RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317058.7

SGF29-201, Transcript of SAGA complex associated factor 29, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGF29, Length 1,153 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29-201ENST00000317058 ROS1P08922 2347 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 TVP23AA6NH52 213 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 H0YHG0 523 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 SNAP29O95721 258 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 COX5BP10606 129 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 CDC42P60953 191 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 HGFACQ04756 655 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 KLHL12Q53G59 568 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 LINC01590Q5TEZ4 76 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 ZNF544Q6NX49 715 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 CCL19Q99731 98 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 SLC29A1Q99808 456 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa14.87□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 PRKYO43930 277 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 ATE1O95260 518 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 CCNOP22674 350 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 NR4A1P22736 598 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 GSTT1P30711 240 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 GGT2P36268 569 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 HTR5AP47898 357 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 ENTPD1P49961 510 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 FABP6P51161 128 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 HIST1H3AP68431 136 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 RAB35Q15286 201 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 KRT80Q6KB66 452 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 FBXL14Q8N1E6 418 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 ZNF511Q8NB15 262 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 TMEM163Q8TC26 289 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 PIGTQ969N2 578 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 TOR3AQ9H497 397 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 CA10Q9NS85 328 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.86□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 PLCE1Q9P212 2302 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 C5orf49A4QMS7 147 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 RER1O15258 196 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 SYNGR3O43761 229 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 SPARCP09486 303 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 DANCRP0C864 163 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 CCL2P13500 99 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 PCSK6P29122 969 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 TTKP33981 857 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 RAD52P43351 418 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 RPS7P62081 194 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 APOFQ13790 326 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 TEX30Q5JUR7 227 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 AGAP6Q5VW22 663 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 CORO6Q6QEF8 472 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 VHLLQ6RSH7 139 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 ARL9Q6T311 187 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 RDH12Q96NR8 316 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 INTS14Q96SY0 518 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 WDR76Q9H967 626 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 IMPAD1Q9NX62 359 aa14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 AKAP6Q13023 2319 aa14.84□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 PDZD2O15018 2839 aa14.84□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.84□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 CD53P19397 219 aa14.84□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 SLC2A5P22732 501 aa14.84□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 GLRXP35754 106 aa14.84□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 EFNB1P98172 346 aa14.84□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 LRRC36Q1X8D7 754 aa14.84□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 LPCAT4Q643R3 524 aa14.84□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SGF29-201ENST00000317058 MUC15Q8N387 334 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms