RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290378.4

ACTC1-201, Transcript of actin, alpha, cardiac muscle 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTC1, Length 4,106 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1-201ENST00000290378 FAM174AQ8TBP5 190 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 C15orf40Q8WUR7 153 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 METTL21AQ8WXB1 218 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 LRIT1Q9P2V4 623 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 WASF3Q9UPY6 502 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 DSPPQ9NZW4 1301 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 IFNA17P01571 189 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 QDPRP09417 244 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 ABCD3P28288 659 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 EIF1P41567 113 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 SSTP61278 116 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 RPS15P62841 145 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 HNF4GQ14541 408 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 STAC2Q6ZMT1 411 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 GPR148Q8TDV2 347 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 RNF141Q8WVD5 230 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 DNAJC13O75165 2243 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 A0A1B0GWA3 101 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 RENP00797 406 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 MBP02144 154 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 IL12BP29460 328 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 NPY4RP50391 375 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 REEP5Q00765 189 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 HIST2H3AQ71DI3 136 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 COX15Q7KZN9 410 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 TEX101Q9BY14 249 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 Q9N2J8 555 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 KCNJ16Q9NPI9 418 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 CMC2Q9NRP2 79 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 PARPBPQ9NWS1 579 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 SLC22A13Q9Y226 551 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa10□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 SDK2Q58EX2 2172 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 PLPP2O43688 288 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 OR2T1O43869 369 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF217O75362 1048 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 OR2T7P0C7T2 308 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 FAM157BP0CG42 384 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 ST6GAL1P15907 406 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 KIR2DS3Q14952 304 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 DCST2Q5T1A1 773 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 OR2T27Q8NH04 317 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 OR10AC1Q8NH08 325 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 FAM3DQ96BQ1 224 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 SPACA1Q9HBV2 294 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 MED17Q9NVC6 651 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 NOTCH4Q99466 2003 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 A0A087WV48 116 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 FCARP24071 287 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF85Q03923 595 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 PRSS41Q7RTY9 318 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 DIO2Q92813 273 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 OR51M1Q9H341 326 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 SEC61A2Q9H9S3 476 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 TCAPO15273 167 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 EFEMP2O95967 443 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 SERPINF1P36955 418 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 PCP4P48539 62 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 RAB5CP51148 216 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 NSDHLQ15738 373 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 Q499Y3 187 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 OR5T1Q8NG75 326 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 PNPLA2Q96AD5 504 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 CMBLQ96DG6 245 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 ELOVL3Q9HB03 270 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 A0A0J9YY10 115 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 GAAP10253 952 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF823P16415 610 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 EFNB2P52799 333 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 TAS2R19P59542 299 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 ACY1Q03154 408 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF793Q6ZN11 406 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 FAM71CQ8NEG0 241 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 PPP1R14AQ96A00 147 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ACTC1-201ENST00000290378 BMFQ96LC9 184 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms