RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 PTX4Q96A99 478 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ORAI1Q96D31 301 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 MOGAT1Q96PD6 335 aa7.99□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 IDSB3KWA1 339 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 D6RAR5 112 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 LMO7DNF2Z398 122 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 BIDP55957 195 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 SLC37A1P57057 533 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 TSC22D1Q15714 1073 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CARD17Q5XLA6 110 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 DOK3Q7L591 496 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CD163Q86VB7 1156 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 FGGYQ96C11 551 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 UQCC2Q9BRT2 126 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 NINQ8N4C6 2090 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 SLC22A23A1A5C7 686 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 METTL12A8MUP2 240 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 NPIPB9F8W1W9 429 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 H3BUI4 141 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 M0QYG6 137 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 GMDSO60547 372 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 SIX6O95475 246 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 RPA2P15927 270 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 BLOC1S1P78537 153 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 C9orf50Q5SZB4 431 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 FDX2Q6P4F2 183 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 LYG2Q86SG7 212 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CADM4Q8NFZ8 388 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 RAB3CQ96E17 227 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 OR5B2Q96R09 309 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 VDAC3Q9Y277 283 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 LRP12Q9Y561 859 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 RFXAPO00287 272 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ALOX12BO75342 701 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 LAP3P28838 519 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CSNK1A1P48729 337 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ARSKQ6UWY0 536 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 SLAMF6Q96DU3 332 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 PIGMQ9H3S5 423 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 OBSL1O75147 1896 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 DOCK6Q96HP0 2047 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 H3BML4 177 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 STK17BO94768 372 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 GABREP78334 506 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 DCDP81605 110 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 MC2RQ01718 297 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CD226Q15762 336 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 EXD3Q8N9H8 876 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 FAHD2AQ96GK7 314 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 OR10A2Q9H208 303 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 FGF21Q9NSA1 209 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 CA14Q9ULX7 337 aa7.98□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 SULT2B1O00204 365 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 PLPP3O14495 311 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 HPXP02790 462 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 FAM157BP0CG42 384 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 FSTP19883 344 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 OR1D5P58170 312 aa7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
HERC3-201ENST00000264345 FAAP20Q6NZ36 180 aa7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms