RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 NOX3Q9HBY0 568 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 COPS3Q9UNS2 423 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 BTBD17A6NE02 478 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 SYT5O00445 386 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 MT-ATP6P00846 226 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 PRSS3P35030 304 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 SLC35A2P78381 396 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 OR4F15Q8NGB8 312 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 ZBTB8AQ96BR9 441 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 UPRTQ96BW1 309 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 B3GNT2Q9NY97 397 aa9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 GASTP01350 101 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 CNR1P21554 472 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 BCORP1Q8N888 145 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 OR4N2Q8NGD1 307 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 OR10K1Q8NGX5 313 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 RNF141Q8WVD5 230 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 SLC25A18Q9H1K4 315 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 ATP23Q9Y6H3 246 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 TMEM235A6NFC5 223 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 CD300LBA8K4G0 201 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 HRO43593 1189 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 ARRB2P32121 409 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 TPPP2P59282 170 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 HES1Q14469 280 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 OPCMLQ14982 345 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 OR7E24Q6IFN5 339 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 MBOAT4Q96T53 435 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 SGPP1Q9BX95 441 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 APEHP13798 732 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 CTRB1P17538 263 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 IHHQ14623 411 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 FCRL1Q96LA6 429 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 TOLLIPQ9H0E2 274 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 FZD6O60353 706 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 RD3LP0DJH9 198 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 GABRA5P31644 462 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 PPICP45877 212 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 BAK1Q16611 211 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 PLK5Q496M5 336 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 KDM4DQ6B0I6 523 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 NEURL2Q9BR09 285 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 B3GAT1Q9P2W7 334 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 RCE1Q9Y256 329 aa9.95□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 TRAV17A0A0B4J275 112 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 FGF17O60258 216 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 FBXO45P0C2W1 286 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 CLEC2LP0C7M8 214 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 RAB1AP62820 205 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 BTG2P78543 158 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 MFAP5Q13361 173 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 GPR176Q14439 515 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 CLINT1Q14677 625 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 STEAP2Q8NFT2 490 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 PSMF1Q92530 271 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 GPR78Q96P69 363 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 SORCS2Q96PQ0 1159 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 METTL9Q9H1A3 318 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 D6RAR5 112 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 H7C1C5 153 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 OR2J2O76002 312 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 CRHP06850 196 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 NAT2P11245 290 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 TCTAP57738 103 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 RTL6Q6ICC9 239 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 ADAM5Q6NVV9 412 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 BTNL8Q6UX41 500 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa9.94□□□□□ -0.82
URB2-201ENST00000258243 LFNGQ8NES3 379 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms