RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 ALDOBP05062 364 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC37A1P57057 533 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF4P78317 190 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 MFAP5Q13361 173 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FIGNL1Q6PIW4 674 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 FCRLAQ7L513 359 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 BEX1Q9HBH7 125 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R8Q9NYW2 309 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 MFSD2BA6NFX1 497 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 PIN1P1O15428 100 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SCO1O75880 301 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ACSM4P0C7M7 580 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 DLX5P56178 289 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 PLAURQ03405 335 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 HES5Q5TA89 166 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 MOSPD2Q8NHP6 518 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 CTHRC1Q96CG8 243 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ELMOD3Q96FG2 381 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 GFI1Q99684 422 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 DTX4Q9Y2E6 619 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 MCRIP1C9JLW8 97 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 CTRB1P17538 263 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 P2RX1P51575 399 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD17BQ5VST6 288 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 CTRB2Q6GPI1 263 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 IGFL3Q6UXB1 125 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 OVCH2Q7RTZ1 564 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNPRQ8TBG9 265 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 SDHAF2Q9NX18 166 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF69Q9UC07 566 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPNS1-201ENST00000246533 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2QL1A1L167 161 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 NPIPA7E9PJI5 369 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF432O94892 652 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 NPIPA8P0DM63 369 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SFTPCP11686 197 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 GALNSP34059 522 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD52P43351 418 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 HCCSP53701 268 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 MLF1P58340 268 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 FUT7Q11130 342 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF843Q8N446 348 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF615Q8N8J6 731 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SCARB1Q8WTV0 552 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 AIFM2Q9BRQ8 373 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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CAPNS1-201ENST00000246533 COPS7AQ9UBW8 275 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFAND5O76080 213 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CBX7O95931 251 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCL2P19875 107 aa23.57■■□□□ 1.36
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CAPNS1-201ENST00000246533 NPEPL1Q8NDH3 523 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 LMF1Q96S06 567 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 PFDN2Q9UHV9 154 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2J2O76002 312 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 GLCEO94923 617 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2ABP04908 130 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 NGFRP08138 427 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SPI1P17947 270 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 S100A11P31949 105 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 PRPS1P60891 318 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM255AQ5JRV8 349 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAAF1Q8NEP3 725 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 THRSPQ92748 146 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2ACQ93077 130 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
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CAPNS1-201ENST00000246533 CHIAQ9BZP6 476 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC19A3Q9BZV2 496 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10A5Q9H207 317 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 TCF7L1Q9HCS4 588 aa23.56■■□□□ 1.36
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CAPNS1-201ENST00000246533 MYOTQ9UBF9 498 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5V1Q9UGF6 321 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF337Q9Y3M9 751 aa23.56■■□□□ 1.36
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGF2P01344 180 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 Q499Y3 187 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF684Q5T5D7 378 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 SPINK14Q6IE38 97 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 MTFR2Q6P444 385 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM122CQ6P4D5 195 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-201ENST00000246533 CHMP1BQ7LBR1 199 aa23.55■■□□□ 1.36
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