RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602498.1

HCG18-243, Transcript of HLA complex group 18, human

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 327 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCG18-243	ENST00000602498	TAF11	Q15544	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	USP51	Q70EK9	711 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	PHC2	Q8IXK0	858 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	LIPH	Q8WWY8	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	CCL17	Q92583	94 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	RDH5	Q92781	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	ALG12	Q9BV10	488 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	WDR76	Q9H967	626 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	DSCAM	O60469	2012 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	PRSS37	A4D1T9	235 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498		A6NIZ1	184 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	DCTN6	O00399	190 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	PTP4A3	O75365	173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	NDUFB2	O95178	105 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	GADD45G	O95257	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	ABHD16A	O95870	558 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	PTH	P01270	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	IFNA2	P01563	188 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	IGHM	P01871	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	CST2	P09228	141 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	RHCE	P18577	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	PRDX6	P30041	224 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	RRM2	P31350	389 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF81	P51508	661 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	FXYD6P3	P58550	94 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	SELENOV	P59797	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	RAP1B	P61224	184 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	PPP1CB	P62140	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	RAP1A	P62834	184 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	FAM27B	Q5VT28	67 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	CMBL	Q96DG6	245 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	PYURF	Q96I23	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HCG18-243	ENST00000602498	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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