RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592275.5

USP36-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 4

Gene USP36, Length 594 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-222	ENST00000592275	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	SLC3A1	Q07837	685 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	FOXL1	Q12952	345 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	ZNF154	Q13106	437 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	CDK5R2	Q13319	367 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	ABHD4	Q8TB40	342 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	TMEM239	Q8WW34	195 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	NSMAF	Q92636	917 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	ALG12	Q9BV10	488 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	MSL2	Q9HCI7	577 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		11.92	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	PLSCR5	A0PG75	271 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	ISPD	A4D126	451 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	SCG5	P05408	212 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	FPR2	P25090	351 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	LAP3	P28838	519 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	PAX2	Q02962	417 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	CD47	Q08722	323 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	PSG7	Q13046	419 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	NFYC	Q13952	458 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	LAPTM4A	Q15012	233 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	SGCA	Q16586	387 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	MTX3	Q5HYI7	312 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	ZNF774	Q6NX45	483 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	DIRC2	Q96SL1	478 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	NUP50	Q9UKX7	468 aa		11.91	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	GMNC	A6NCL1	334 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	ANGPT2	O15123	496 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	THRB	P10828	461 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	KITLG	P21583	273 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	SLC6A9	P48067	706 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	TAS2R41	P59536	307 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	ZMYND11	Q15326	602 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	TAF11	Q15544	211 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	TTMP	Q5BVD1	217 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	RABL3	Q5HYI8	236 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	ST7L	Q8TDW4	575 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	C4orf45	Q96LM5	186 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	DUX5	Q96PT3	197 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		11.9	□□□□□ -0.5
USP36-222	ENST00000592275	CLDN34	H7C241	214 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	NR2C1	P13056	603 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	MSR1	P21757	451 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	ERF	P50548	548 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	ALG10	Q5BKT4	473 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	SYT9	Q86SS6	491 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	SPIC	Q8N5J4	248 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	SAMD8	Q96LT4	415 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	POLE4	Q9NR33	117 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	BAG5	Q9UL15	447 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	MED31	Q9Y3C7	131 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	AUP1	Q9Y679	476 aa		11.89	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	PLAT	P00750	562 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	SBK2	P0C263	348 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	COX5B	P10606	129 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	OR1E2	P47887	323 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	MMP16	P51512	607 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	BTG1	P62324	171 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	PAX8	Q06710	450 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.88	□□□□□ -0.51
USP36-222	ENST00000592275	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		11.88	□□□□□ -0.51

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