RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583340.1

SUPT6H-208, Transcript of SPT6 homolog, histone chaperone, humanhuman

TSL 3

Gene SUPT6H, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT6H-208ENST00000583340 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 MS4A18H0YCH9 400 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 M0R129 80 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 M0R1B8 84 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 ABCD4O14678 606 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 SURF4O15260 269 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 SIAH2O43255 324 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 ZNF432O94892 652 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 FARS2O95363 451 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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SUPT6H-208ENST00000583340 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 ASAH2BP0C7U1 165 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 BMP4P12644 408 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 IFNGR1P15260 489 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 CD36P16671 472 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 ZNF3P17036 446 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 FUT1P19526 365 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 PTNP21246 168 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 PAICSP22234 425 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 EDNRAP25101 427 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 PCSK6P29122 969 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 NTF4P34130 210 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 CAPZA2P47755 286 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 ZNF83P51522 516 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 ZNF84P51523 738 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 CDH11P55287 796 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 BIDP55957 195 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 CLRN1P58418 232 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 DGUOKQ16854 277 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 NXNL2Q5VZ03 156 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 CARD17Q5XLA6 110 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 SLC22A25Q6T423 547 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 WDR88Q6ZMY6 472 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 C20orf196Q8IYI0 205 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 ZNF611Q8N823 705 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 OR8D4Q8NGM9 314 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 FNDC8Q8TC99 324 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 LIPHQ8WWY8 451 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 NRGNQ92686 78 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 GPA33Q99795 319 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.5□□□□□ -1.21
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SUPT6H-208ENST00000583340 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 GPR35Q9HC97 309 aa7.5□□□□□ -1.21
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SUPT6H-208ENST00000583340 INIPQ9NRY2 104 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.5□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 PDZD2O15018 2839 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 TMEM129A0AVI4 362 aa7.49□□□□□ -1.21
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SUPT6H-208ENST00000583340 AIREO43918 545 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 UPK3AO75631 287 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 NDUFB2O95178 105 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 PTHP01270 115 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 CRYAAP02489 173 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 CD53P19397 219 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 CD40P25942 277 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 HTR1FP30939 366 aa7.49□□□□□ -1.21
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SUPT6H-208ENST00000583340 TGFBR2P37173 567 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 MTNR1AP48039 350 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 TUBA1BP68363 451 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 LTBQ06643 244 aa7.49□□□□□ -1.21
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SUPT6H-208ENST00000583340 CAMK2DQ13557 499 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 MED22Q15528 200 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa7.49□□□□□ -1.21
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SUPT6H-208ENST00000583340 SHEQ5VZ18 495 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 USP43Q70EL4 1123 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 TUBA1AQ71U36 451 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 OAFQ86UD1 273 aa7.49□□□□□ -1.21
SUPT6H-208ENST00000583340 TMEM123Q8N131 208 aa7.49□□□□□ -1.21
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