RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 TSTQ16762 297 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 DCXRQ7Z4W1 244 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 FOXB1Q99853 325 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTYH2Q9BSA4 534 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 TRIM36Q9NQ86 728 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM38BQ9NVV0 291 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 GNG8Q9UK08 70 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF835Q9Y2P0 537 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 LHFPL6Q9Y693 200 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 CACNA1CQ13936 2221 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF587BE7ETH6 402 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC19A2O60779 497 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 EDN3P14138 238 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 CD36P16671 472 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 TGFBR2P37173 567 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM27BQ5VT28 67 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 CORO6Q6QEF8 472 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 UBE2J2Q8N2K1 259 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ST7LQ8TDW4 575 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 SIAEQ9HAT2 523 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 POLR1DQ9Y2S0 133 aa20.59■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCRL2O00421 344 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 TOXO94900 526 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 CPEP16870 476 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ROM1Q03395 351 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 TPBGQ13641 420 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 SSX1Q16384 188 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 FBXW9Q5XUX1 488 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZGRF1Q86YA3 2104 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 DOLPP1Q86YN1 238 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR52N5Q8NH56 324 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 PELI1Q96FA3 418 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR8B4Q96RC9 309 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF416Q9BWM5 594 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ACOXLQ9NUZ1 547 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ASH2LQ9UBL3 628 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 MALT1Q9UDY8 824 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 PRSS50Q9UI38 385 aa20.58■□□□□ 0.89
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATRXP46100 2492 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 METTL15A6NJ78 407 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 KRT8P05787 483 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 TACSTD2P09758 323 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 TIMP3P35625 211 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 PER3P56645 1201 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 NRN1LQ496H8 165 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 LIPKQ5VXJ0 399 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 PHC2Q8IXK0 858 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF679Q8IYX0 411 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 WBP1Q96G27 269 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 MROQ9BYG7 248 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 C1orf198Q9H425 327 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 IKZF2Q9UKS7 526 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC160A6NGH7 325 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 E9PI62 339 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABHD16AO95870 558 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR8G3PP0DMU2 310 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 SIRPAP78324 504 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 RBPJQ06330 500 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAPQ12884 760 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 FOXF2Q12947 444 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 C3P1Q6ZMU1 363 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATCAYQ86WG3 371 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRRC18Q8N456 261 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 RPRMLQ8N4K4 120 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 OR6K3Q8NGY3 331 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 UFD1Q92890 307 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 MAP6Q96JE9 813 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa20.57■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa20.56■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 B4GALT1P15291 398 aa20.56■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 TAS2R43P59537 309 aa20.56■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 LIPNQ5VXI9 398 aa20.56■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 TFAP2EQ6VUC0 442 aa20.56■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM220AQ7Z4H9 259 aa20.56■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 P2RY8Q86VZ1 359 aa20.56■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZFP41Q8N8Y5 198 aa20.56■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 NDUFB11Q9NX14 153 aa20.56■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 TNFSF13O75888 250 aa20.55■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 WNT11O96014 354 aa20.55■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 IL2RAP01589 272 aa20.55■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 CRHP06850 196 aa20.55■□□□□ 0.88
RARA-AS1-201ENST00000581080 CELP19835 753 aa20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms