RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 CDH10Q9Y6N8 788 aa10.02□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 PLCE1Q9P212 2302 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 C5orf49A4QMS7 147 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ACOT8O14734 319 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ARPC3O15145 178 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 SYNGR3O43761 229 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 IDH3BO43837 385 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 LY6G6DO95868 133 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 CST1P01037 141 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ADRA2AP08913 450 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 GSTM3P21266 225 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 PSG4Q00888 419 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 AQP6Q13520 282 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 NKPD1Q17RQ9 610 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 DNM1P46Q6ZS02 220 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 PTCHD4Q6ZW05 846 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 AQP11Q8NBQ7 271 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 OR10H5Q8NGA6 315 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 SNX33Q8WV41 574 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 FOXN4Q96NZ1 517 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 SNX18Q96RF0 628 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 DOK1Q99704 481 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 PIMREGQ9BSJ6 248 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 MS4A5Q9H3V2 200 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 EMC7Q9NPA0 242 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 REV1Q9UBZ9 1251 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 DUSP13Q9UII6 198 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 U3KQV3 271 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ALPK2Q86TB3 2170 aa10.01□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 NDUFS8O00217 210 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 SGCEO43556 437 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 DOK2O60496 412 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 E2F6O75461 281 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ATP5HO75947 161 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 MT-ND5P03915 603 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 GCH1P30793 250 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 HTR5AP47898 357 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ARHGDIAP52565 204 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 UCP2P55851 309 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 MOGQ16653 247 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 MICAQ29983 383 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ZNF774Q6NX45 483 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 Q71RC1 249 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 C1orf174Q8IYL3 243 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ADGRG5Q8IZF4 528 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 SDR9C7Q8NEX9 313 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 OR10G2Q8NGC3 310 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 OR4C15Q8NGM1 316 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 OR1J1Q8NGS3 322 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 OR4K13Q8NH42 304 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 SYNPRQ8TBG9 265 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 C10orf105Q8TEF2 133 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 CANT1Q8WVQ1 401 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 POM121L2Q96KW2 1035 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 NMNAT3Q96T66 252 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 CHID1Q9BWS9 393 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 NUAK2Q9H093 628 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 RACGAP1Q9H0H5 632 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 WNT5BQ9H1J7 359 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 EGLN3Q9H6Z9 239 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ELOVL3Q9HB03 270 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 PLEK2Q9NYT0 353 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 FZR1Q9UM11 496 aa10□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 TMEM129A0AVI4 362 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 LY6HO94772 140 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 GASTP01350 101 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 COX5BP10606 129 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 DAOP14920 347 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ALDH3B1P43353 468 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 PPP2R2BQ00005 443 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 GLO1Q04760 184 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 BNIP1Q12981 228 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ZNF718Q3SXZ3 478 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 SLC36A3Q495N2 470 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ZNF540Q8NDQ6 660 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 ABHD4Q8TB40 342 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 GIPC3Q8TF64 312 aa9.99□□□□□ -0.81
GGA3-204ENST00000578208 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1060.1 ms