RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577241.1

MSI2-205, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 710 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-205	ENST00000577241	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	NUAK2	Q9H093	628 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	GPR160	Q9UJ42	338 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241		U3KQV3	271 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SYNGR3	O43761	229 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	GLO1	Q04760	184 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	AQP6	Q13520	282 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	KCNMB1	Q16558	191 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	MOG	Q16653	247 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	LEG1	Q6P5S2	330 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SVOPL	Q8N434	492 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	GIPC3	Q8TF64	312 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	OCEL1	Q9H607	264 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	RERGL	Q9H628	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	TMEM129	A0AVI4	362 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	C5orf49	A4QMS7	147 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241		M0R233	179 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	NDUFS8	O00217	210 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	GPRIN2	O60269	458 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	LCK	P06239	509 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	CCL2	P13500	99 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SLC25A16	P16260	332 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	CCNO	P22674	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	ARHGDIA	P52565	204 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	OR4K13	Q8NH42	304 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	FAM168A	Q92567	244 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	NMNAT3	Q96T66	252 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	REG4	Q9BYZ8	158 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	B9D1	Q9UPM9	204 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	BHLHE40	O14503	412 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SGCE	O43556	437 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	ICMT	O60725	284 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	E2F6	O75461	281 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	FAM157B	P0CG42	384 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	TUBG1	P23258	451 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	OR2T33	Q8NG76	320 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	EMC7	Q9NPA0	242 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	VNN3	Q9NY84	501 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	DUSP13	Q9UII6	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MSI2-205	ENST00000577241	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241		H3BSA7	217 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	FKBP6	O75344	327 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	MT-ND5	P03915	603 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	ADRA2A	P08913	450 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF250	P15622	560 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	CENPA	P49450	140 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	PDLIM4	P50479	330 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	CBX1	P83916	185 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF774	Q6NX45	483 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	OR6V1	Q8N148	313 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	LNX2	Q8N448	690 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
MSI2-205	ENST00000577241	ZNF525	Q8N782	197 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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