RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TAS2R9	Q9NYW1	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ADA2	Q9NZK5	511 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RASD1	Q9Y272	281 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR2AG2	A6NM03	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909		F8VP50	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909		M0R036	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR7A17	O14581	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MSH4	O15457	936 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	EMC8	O43402	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCDC22	O60826	627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MED6	O75586	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZMPSTE24	O75844	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SULT1C4	O75897	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	DCTN3	O75935	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	HP	P00738	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OCM2	P0CE71	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	LAMP1	P11279	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SCGB1A1	P11684	91 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	IDS	P22304	550 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MAGEA12	P43365	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF45	Q02386	682 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TNFRSF9	Q07011	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PIGG	Q5H8A4	983 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF691	Q5VV52	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACTL9	Q8TC94	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC38A4	Q969I6	547 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MND1	Q9BWT6	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	HINT2	Q9BX68	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRABD	Q9H4I3	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CUTC	Q9NTM9	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	AHSP	Q9NZD4	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PAK5	Q9P286	719 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OARD1	Q9Y530	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TONSL	Q96HA7	1378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CLIP1	P30622	1438 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909		E7EWF7	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	WWP2	O00308	870 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	BHLHE40	O14503	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GOSR2	O14653	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ABCD4	O14678	606 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	UGT1A9	O60656	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC2A10	O95528	541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PPBP	P02775	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FTH1	P02794	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CDK1	P06493	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CD55	P08174	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	DCK	P27707	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SHC1	P29353	583 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MPI	P34949	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	HPCAL1	P37235	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PSPH	P78330	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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