RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	OR5K4	A6NMS3	321 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HACD1	B0YJ81	288 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		H7C2Y5	167 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		K7ENP7	123 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FCN1	O00602	326 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PLPP1	O14494	284 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC16A4	O15374	487 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HCRTR1	O43613	425 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	NGF	P01138	241 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OXT	P01178	125 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FGG	P02679	453 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PVR	P15151	417 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HLA-DMA	P28067	261 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1D4	P47884	311 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PAX9	P55771	341 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PEX3	P56589	373 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	LMO4	P61968	165 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ARF6	P62330	175 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	DHODH	Q02127	395 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SP4	Q02446	784 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MGAT3	Q09327	533 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPAN31	Q12999	210 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TPBG	Q13641	420 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL6IP1	Q15041	203 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	NECTIN1	Q15223	517 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TAL2	Q16559	108 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PARP15	Q460N3	678 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	COX19	Q49B96	90 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TTMP	Q5BVD1	217 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	VWA2	Q5GFL6	755 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR38	Q5JTN6	314 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ACER2	Q5QJU3	275 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PEX26	Q7Z412	305 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CA13	Q8N1Q1	262 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF843	Q8N446	348 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ACBD4	Q8NC06	268 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS33	Q8NF86	280 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2L2	Q8NH16	312 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR51A7	Q8NH64	312 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ENKUR	Q8TC29	256 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF75A	Q96N20	296 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	COPS4	Q9BT78	406 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	OR51J1	Q9H342	316 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SP140L	Q9H930	580 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	AMBN	Q9NP70	447 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	EXD2	Q9NVH0	621 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ING4	Q9UNL4	249 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		2.24	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	CNTNAP1	P78357	1384 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF233	A6NK53	670 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	HIDE1	A8MVS5	230 aa		2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
AKAP13-223	ENST00000560957		M0R036	132 aa		2.23	□□□□□ -2.05

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