RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 PPP1R35Q8TAP8 253 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 VPS33AQ96AX1 596 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 WDFY2Q96P53 400 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 ZNF607Q96SK3 696 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 TRIM15Q9C019 465 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 SIRPDQ9H106 197 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 CALML5Q9NZT1 146 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 CTSZQ9UBR2 303 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 FBLN5Q9UBX5 448 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 VPREB3Q9UKI3 123 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 A0A0B4J2E0 115 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 A0A0G2JPF8 293 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 A0A1B0GX12 115 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 SMIM23A6NLE4 172 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 H3BSA7 217 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 XPNPEP2O43895 674 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 TPST1O60507 370 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 ENTPD5O75356 428 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 FCN3O75636 299 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 IGLL1P15814 213 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 CASQ1P31415 396 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 DEFB121Q5J5C9 76 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 ULK3Q6PHR2 472 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 KLHDC1Q8N7A1 406 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 TRIML2Q8N7C3 387 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 SCCPDHQ8NBX0 429 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 OR10AD1Q8NGE0 317 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 MAL2Q969L2 176 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 SLC35B4Q969S0 331 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 C4orf45Q96LM5 186 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 TXLNGYQ9BZA5 131 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 IFT52Q9Y366 437 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 USH1CQ9Y6N9 552 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 PHYHO14832 338 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 KITLGP21583 273 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 CPT2P23786 658 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 GABRA5P31644 462 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 CDH12P55289 794 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 KRTAP10-11P60412 298 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 TAF11Q15544 211 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 OR1Q1Q15612 314 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 CEP85LQ5SZL2 805 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 FAM91A1Q658Y4 838 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 MOGAT3Q86VF5 341 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 CMBLQ96DG6 245 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 MEGF10Q96KG7 1140 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 OR52E6Q96RD3 313 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 EPYCQ99645 322 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 OR2H1Q9GZK4 316 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 PPA2Q9H2U2 334 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 DPAGT1Q9H3H5 408 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 SIAEQ9HAT2 523 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 ZNRD1Q9P1U0 126 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 RNF13O43567 381 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 ITM2AO43736 263 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 KRT75O95678 551 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 IGHG1P01857 330 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 TGFBR2P37173 567 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 PSMB10P40306 273 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 ZNF84P51523 738 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 DLX1P56177 255 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 CLRN1P58418 232 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 FMODQ06828 376 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 DPY19L1Q2PZI1 675 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 ZBTB37Q5TC79 503 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 NLRC3Q7RTR2 1065 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 HOMEZQ8IX15 550 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 OR5AS1Q8N127 324 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 ATG16L2Q8NAA4 619 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 NOXO1Q8NFA2 376 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 LRTOMTQ8WZ04 291 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 SEPHS2Q99611 448 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 SMURF1Q9HCE7 757 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 MEGF11A6BM72 1044 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 TRMUO75648 421 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 OR6A2O95222 327 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 CH25HO95992 272 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 ARF6P62330 175 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 CD69Q07108 199 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 SGCAQ16586 387 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 ZNF74Q16587 644 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-230ENST00000551968 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 231.2 ms