RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 PRPS1P60891 318 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NTHL1P78549 312 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SCGB2A2Q13296 93 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 RGNQ15493 299 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SLC35D3Q5M8T2 416 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 UEVLDQ8IX04 471 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NANOGP1Q8N7R0 232 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GRHL3Q8TE85 626 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 THAP4Q8WY91 577 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 BORCS7Q96B45 105 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NTNG2Q96CW9 530 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 MSLNLQ96KJ4 702 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SPACA7Q96KW9 195 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GPR137Q96N19 417 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ARV1Q9H2C2 271 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 VCX2Q9H322 139 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 RHOFQ9HBH0 211 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SPINT1O43278 529 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 KCNK5O95279 499 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ARG1P05089 322 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SFTPCP11686 197 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 PTHLHP12272 177 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TNFSF4P23510 183 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OPRD1P41143 372 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 RAB28P51157 221 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CHRFAM7AQ494W8 412 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 AGBL4Q5VU57 503 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FAAP20Q6NZ36 180 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 COMMD6Q7Z4G1 85 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GPR119Q8TDV5 335 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 THEM6Q8WUY1 208 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NEIL2Q969S2 332 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 UPRTQ96BW1 309 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ORAI3Q9BRQ5 295 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 VAMP8Q9BV40 100 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SARGQ9BW04 601 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 RXFP3Q9NSD7 469 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 C1orf226A1L170 272 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TTRP02766 147 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OPN1MWP04001 364 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FURINP09958 794 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OPN1MW2P0DN77 364 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OPN1MW3P0DN78 364 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SLC19A1P41440 591 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 WNT3P56703 355 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CLDN12P56749 244 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TPPP2P59282 170 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 REC114Q7Z4M0 266 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR4F15Q8NGB8 312 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FBLIM1Q8WUP2 373 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 PNPLA2Q96AD5 504 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 UHRF2Q96PU4 802 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NRIP3Q9NQ35 241 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GPR173Q9NS66 373 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 C5orf52A6NGY3 159 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 UPK1AO00322 258 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 HOXB5P09067 269 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 CPEP16870 476 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SHC1P29353 583 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 DGCR2P98153 550 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 HYAL2Q12891 473 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TSPAN31Q12999 210 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ADIRFQ15847 76 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GAB4Q2WGN9 574 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 ACSM3Q53FZ2 586 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM64Q6YI46 380 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 OR5M9Q8NGP3 310 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SMIM4Q8WVI0 70 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NXPE3Q969Y0 559 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SORCS2Q96PQ0 1159 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 A4GALTQ9NPC4 353 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SOHLH2Q9NX45 425 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SPANXCQ9NY87 97 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 BET1LQ9NYM9 111 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 A0A0U1RQS6 177 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1B0GV72 72 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 PRRT4C9JH25 899 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 MGST1P10620 155 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 NPY4RP50391 375 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRD-214ENST00000540109 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms