RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 TM9SF4Q92544 642 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 MOCOSQ96EN8 888 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 SMIM10Q96HG1 83 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 OR2V2Q96R30 315 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 NICN1Q9BSH3 213 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 RHOFQ9HBH0 211 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 ADA2Q9NZK5 511 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 TMEM216Q9P0N5 145 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 RHCGQ9UBD6 479 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 GNG8Q9UK08 70 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 SGK494L7N484 410 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 PPP6CO00743 305 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 COPEO14579 308 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 IMPA2O14732 288 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 AP2A1O95782 977 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 EML2O95834 649 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 FOLR2P14207 255 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 CBLP22681 906 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 STOMP27105 288 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 PGM1P36871 562 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 UCP2P55851 309 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 GUCA2BQ16661 112 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 PIGGQ5H8A4 983 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 AVPI1Q5T686 147 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 LINGO2Q7L985 606 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 NRMQ8IXM6 262 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 OR5J2Q8NH18 312 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 COQ8AQ8NI60 647 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 DTD2Q96FN9 168 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 CERS2Q96G23 380 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 TMEM56Q96MV1 263 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 OR2M4Q96R27 311 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 TRIB1Q96RU8 372 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 NODALQ96S42 347 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 APOL4Q9BPW4 351 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 VPS25Q9BRG1 176 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 MED20Q9H944 212 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 MEAF6Q9HAF1 191 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 POLE4Q9NR33 117 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 FBXL3Q9UKT7 428 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 SPTBP11277 2137 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-212ENST00000535535 A0A1B0GW55 424 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 TMEM213A2RRL7 107 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 C21orf140B9A014 251 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 J3KR12 359 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SLC28A1O00337 649 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 OR2B3O76000 313 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 OR2J2O76002 312 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SEC14L2O76054 403 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 CBX6O95503 412 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 SOD1P00441 154 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 TSPAN8P19075 237 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RAB5CP51148 216 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 DNAJB13P59910 316 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 RBBP4Q09028 425 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 PMPCAQ10713 525 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-212ENST00000535535 NFATC2Q13469 925 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms