RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, human

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRU-210	ENST00000527027	ICMT	O60725	284 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	OR7A10	O76100	309 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	NGF	P01138	241 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	ZNF12	P17014	697 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	ERVK-25	P63136	954 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	CDK5R2	Q13319	367 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	NSMAF	Q92636	917 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	SLC25A28	Q96A46	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	MRI1	Q9BV20	369 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	CLDN34	H7C241	214 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	IGF2	P01344	180 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	TSPAN19	P0C672	248 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	NR2C1	P13056	603 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	ARHGDIA	P52565	204 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	MTPN	P58546	118 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	FMOD	Q06828	376 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	SELPLG	Q14242	412 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	MTX3	Q5HYI7	312 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	ARL9	Q6T311	187 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	PFN4	Q8NHR9	129 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	LIPH	Q8WWY8	451 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	TAMM41	Q96BW9	452 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	SGTB	Q96EQ0	304 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	C4orf45	Q96LM5	186 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	SAMD8	Q96LT4	415 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	CGREF1	Q99674	301 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	GMNC	A6NCL1	334 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	CST2	P09228	141 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	TNFRSF1A	P19438	455 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	LAP3	P28838	519 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	PCGF2	P35227	344 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	PCBD1	P61457	104 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	CD47	Q08722	323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	PSG7	Q13046	419 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	TAF11	Q15544	211 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	DPP10	Q8N608	796 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	RBP7	Q96R05	134 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	SLITRK2	Q9H156	845 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027		A8MXK9	166 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	TNFSF4	P23510	183 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	BTG1	P62324	171 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	PAX8	Q06710	450 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	ZMYND11	Q15326	602 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	ZNF774	Q6NX45	483 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	FNDC8	Q8TC99	324 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	TMEM239	Q8WW34	195 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	ALG12	Q9BV10	488 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	OR5F1	O95221	314 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	GSTM3	P21266	225 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	TUBG1	P23258	451 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	CD80	P33681	288 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	MTNR1A	P48039	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	CRYBA2	P53672	197 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	TAS2R41	P59536	307 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	MIDN	Q504T8	468 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	ESCO2	Q56NI9	601 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-210	ENST00000527027	LEG1	Q6P5S2	330 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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