RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 C4orf46Q504U0 113 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 TSSK4Q6SA08 328 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 BEND4Q6ZU67 534 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 BTN2A1Q7KYR7 527 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 SAXO1Q8IYX7 474 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 OR4M1Q8NGD0 313 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ZNF721Q8TF20 911 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 GHSRQ92847 366 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 AMBNQ9NP70 447 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ENY2Q9NPA8 101 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 NUDT15Q9NV35 164 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 TCFL5Q9UL49 500 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 CA5BQ9Y2D0 317 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 OR5H15A6NDH6 313 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 NPIPB9F8W1W9 429 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 TGM6O95932 706 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 AVPR2P30518 371 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 TNFSF8P32971 234 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ALDH3B1P43353 468 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 MMP16P51512 607 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 GFERP55789 205 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PSG6Q00889 435 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 IL20RBQ6UXL0 311 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 Q6ZS52 159 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 UTS2BQ765I0 119 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 DEFB119Q8N690 84 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 OR1M1Q8NGA1 313 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PAQR8Q8TEZ7 354 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 MENTQ9BUN1 341 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 REV1Q9UBZ9 1251 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PROCRQ9UNN8 238 aa5.28□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 A0A0B4J2A0 478 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 A0A0U1RQV5 110 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 PLPP3O14495 311 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 BHLHE40O14503 412 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 WDR1O75083 606 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 PTP4A3O75365 173 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 SLC34A2O95436 690 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 BGLAPP02818 100 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 HEXAP06865 529 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 IGFBP7Q16270 282 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 CCNJQ5T5M9 372 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 IGF2-ASQ6U949 168 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 FCRLAQ7L513 359 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 NKAIN4Q8IVV8 208 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 SLAMF6Q96DU3 332 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 OPALINQ96PE5 141 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 TBX5Q99593 518 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 OR10A4Q9H209 315 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 LANCL2Q9NS86 450 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 SCN5AQ14524 2016 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 TRAV27A0A087WT01 109 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 A0A1B0GUH1 482 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 PLSCR5A0PG75 271 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 LIPT2A6NK58 231 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 AHRRA9YTQ3 701 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 TK1P04183 234 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ISG15P05161 165 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ZNF35P13682 527 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 KIR2DS2P43631 304 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 PPT1P50897 306 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 PGGT1BP53609 377 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 IST1P53990 364 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 MXD1Q05195 221 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ACER2Q5QJU3 275 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 VASNQ6EMK4 673 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 MARCH3Q86UD3 253 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 IQCF1Q8N6M8 205 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 GATSQ8NAP1 163 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 OR4F15Q8NGB8 312 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 ASB10Q8WXI3 467 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 TRIM8Q9BZR9 551 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 GHITMQ9H3K2 345 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 NOX4Q9NPH5 578 aa5.27□□□□□ -1.57
POLK-215ENST00000514141 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms