RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492973.1

TPR-208, Transcript of translocated promoter region, nuclear basket protein, humanhuman

TSL 2

Gene TPR, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPR-208ENST00000492973 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.06□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.06□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.06□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 A0A1B0GUH1 482 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 LIPT2A6NK58 231 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 LINC01548A6NM66 108 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 GJE1A6NN92 205 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 MS4A18H0YCH9 400 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 H3BN98 237 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 H7C1Q1 480 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 OR2T1O43869 369 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 AQP8O94778 261 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 RCBTB2O95199 551 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 PMS2P2O95744 297 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 RNF224P0DH78 156 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 TFPIP10646 304 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 GABRB1P18505 474 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 DIO1P49895 249 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 RPS6KA3P51812 740 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 CD47Q08722 323 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 PMPCAQ10713 525 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 PON3Q15166 354 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 MS4A18Q3C1V0 323 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 FAM69AQ5T7M9 428 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 C12orf73Q69YU5 71 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 OAFQ86UD1 273 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 NAXEQ8NCW5 288 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 DDIT4LQ96D03 193 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 SNX18Q96RF0 628 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 FKRPQ9H9S5 495 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 NANSQ9NR45 359 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 AASSQ9UDR5 926 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 RNF6Q9Y252 685 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 ZNF175Q9Y473 711 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.05□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 SLC22A20A6NK97 555 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 SULT2B1O00204 365 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 PLPP3O14495 311 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 BHLHE40O14503 412 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 DNPH1O43598 174 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 RAMP1O60894 148 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 NDUFB2O95178 105 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 AHSA1O95433 338 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 MT-ATP6P00846 226 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 HIST1H2ABP04908 130 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 SAGP10523 405 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 GRPRP30550 384 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 IDUAP35475 653 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 TIMP3P35625 211 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 AQP2P41181 271 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 P2RY4P51582 365 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 SMSP52788 366 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 OR2B6P58173 313 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 MYBPC1Q00872 1141 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 ZP4Q12836 540 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 FOXF2Q12947 444 aa6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
TPR-208ENST00000492973 GUSBP1Q15486 140 aa6.04□□□□□ -1.44
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