RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489571.5

PGAP2-223, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 2

Gene PGAP2, Length 879 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-223	ENST00000489571	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	RRM2B	Q7LG56	351 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571		Q96M85	177 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	POLE4	Q9NR33	117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	DYSF	O75923	2080 aa		13.46	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	PRDX6	P30041	224 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	MPV17	P39210	176 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	CRYBB2	P43320	205 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	TEK	Q02763	1124 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	MEST	Q5EB52	335 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF774	Q6NX45	483 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM122B	Q7Z309	247 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SYT9	Q86SS6	491 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ABHD4	Q8TB40	342 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	EMC7	Q9NPA0	242 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	DECR2	Q9NUI1	292 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	TREM2	Q9NZC2	230 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571		A0A1W2PRQ8	180 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571		H3BSA7	217 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	XKRY	O14609	159 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	AHCYL1	O43865	530 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SCG5	P05408	212 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	MSMB	P08118	114 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	GAA	P10253	952 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	RHCE	P18577	417 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	LIMS1	P48059	325 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF81	P51508	661 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	MMP15	P51511	669 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	LMO4	P61968	165 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	PPP1CB	P62140	327 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	DGCR6	Q14129	220 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	RINL	Q6ZS11	566 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	USP51	Q70EK9	711 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	TMEM186	Q96B77	213 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF570	Q96NI8	536 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	WAC	Q9BTA9	647 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	PLSCR5	A0PG75	271 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	PRSS37	A4D1T9	235 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	PTP4A3	O75365	173 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	NDUFB2	O95178	105 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	NGF	P01138	241 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	IGHV1-46	P01743	117 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	COX5B	P10606	129 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	CTLA4	P16410	223 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	OMP	P47874	163 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	FGD3	Q5JSP0	725 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM209A	Q5JX71	171 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	AVPI1	Q5T686	147 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	GLYAT	Q6IB77	296 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	OR51F2	Q8NH61	342 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	RASD2	Q96D21	266 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	C7orf34	Q96L11	122 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	C4orf45	Q96LM5	186 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ADA2	Q9NZK5	511 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	CACNG2	Q9Y698	323 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PGAP2-223	ENST00000489571	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.42	□□□□□ -0.26

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