RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	VNN3	Q9NY84	501 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SNAP29	O95721	258 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	REN	P00797	406 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	GIPR	P48546	466 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MYBPC1	Q00872	1141 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	GALK2	Q01415	458 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP6AP1	Q15904	470 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZSCAN26	Q16670	478 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF519	Q8TB69	540 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424		Q96M85	177 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNK17	Q96T54	332 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SIAE	Q9HAT2	523 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		14.9	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424		G3V2T6	193 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BN98	237 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SOCS2	O14508	198 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ARPC3	O15145	178 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R3D	O95685	299 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNA2	P01563	188 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	THBS2	P35442	1172 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RUNX1T1	Q06455	604 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF786	Q8N393	782 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	IL20	Q9NYY1	176 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR160	Q9UJ42	338 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		14.89	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PRSS37	A4D1T9	235 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC14L2	O76054	403 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TXNDC12	O95881	172 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CRABP1	P29762	137 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SELENOV	P59797	346 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PLP2	Q04941	152 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PIGF	Q07326	219 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MOG	Q16653	247 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	VHLL	Q6RSH7	139 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM122B	Q7Z309	247 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SVOPL	Q8N434	492 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	NSMAF	Q92636	917 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	HPS1	Q92902	700 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	STMN2	Q93045	179 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF121	Q9H920	327 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		14.88	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	GPRIN2	O60269	458 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	IFNG	P01579	166 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF23	P17027	643 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RAD52	P43351	418 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SGCA	Q16586	387 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	OR2T33	Q8NG76	320 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	RASD2	Q96D21	266 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		14.87	□□□□□ -0.03
HDAC10-216	ENST00000489424	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		14.86	□□□□□ -0.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms