RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 CHP2O43745 196 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 SERPINB7O75635 380 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 IGHG1P01857 330 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 MT-ND5P03915 603 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 SCG5P05408 212 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 ADH4P08319 380 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 ACADSP16219 412 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 FUT1P19526 365 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 SLC6A2P23975 617 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 PCGF2P35227 344 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 AQP2P41181 271 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF84P51523 738 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP10-3P60369 221 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 ERVK-25P63136 954 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 IL13RA1P78552 427 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 PAX2Q02962 417 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 FMODQ06828 376 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 PSG7Q13046 419 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 SELPLGQ14242 412 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 SGCAQ16586 387 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 FDX2Q6P4F2 183 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 DLEU7Q6UYE1 221 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 Q6ZR03 302 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 HIPK4Q8NE63 616 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 ASB10Q8WXI3 467 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 NSMAFQ92636 917 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 SPDL1Q96EA4 605 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF607Q96SK3 696 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 GPA33Q99795 319 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 SLITRK2Q9H156 845 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 WNT5BQ9H1J7 359 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 SIAEQ9HAT2 523 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC167Q9P0B6 97 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF229Q9UJW7 825 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 GMEB1Q9Y692 573 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-208ENST00000479480 PLSCR5A0PG75 271 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM120BA0PK00 339 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 F5H0A9 414 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 FMO6PO60774 539 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 ENTPD5O75356 428 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 IGHMP01871 453 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 HIST1H2ABP04908 130 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 CD55P08174 381 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 WNT2P09544 360 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 UMPSP11172 480 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 CD247P20963 164 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 LAP3P28838 519 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 PPP1CBP62140 327 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 SLC3A1Q07837 685 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 CDK5R2Q13319 367 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 ZMYND11Q15326 602 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 NRN1LQ496H8 165 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 C10orf128Q5T292 105 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 WDR93Q6P2C0 686 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 C16orf87Q6PH81 154 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 NKAIN4Q8IVV8 208 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF283Q8N7M2 679 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 CLDN22Q8N7P3 220 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 OR52E2Q8NGJ4 325 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 PFN4Q8NHR9 129 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 ABHD4Q8TB40 342 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 EBF4Q9BQW3 602 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 PARD6BQ9BYG5 372 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-208ENST00000479480 OR2H1Q9GZK4 316 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms