RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf3-214ENST00000473778 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf3-214ENST00000473778 OR6M1Q8NGM8 313 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf3-214ENST00000473778 ASB5Q8WWX0 329 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf3-214ENST00000473778 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf3-214ENST00000473778 SLC46A1Q96NT5 459 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf3-214ENST00000473778 LAT2Q9GZY6 243 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf3-214ENST00000473778 SHARPINQ9H0F6 387 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf3-214ENST00000473778 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
C9orf3-214ENST00000473778 SLC39A1Q9NY26 324 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf3-214ENST00000473778 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
C9orf3-214ENST00000473778 GLS2Q9UI32 602 aa9.84□□□□□ -0.83
C9orf3-214ENST00000473778 FITM1A5D6W6 292 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 MFSD2BA6NFX1 497 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 H0YIG0 161 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 SLC17A2O00624 439 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 ADAM10O14672 748 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 ALOX12BO75342 701 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 NUDT14O95848 222 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 GALNSP34059 522 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 CCR5P51681 352 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 SKP1P63208 163 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 ARHGAP40Q5TG30 622 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM225Q6GV28 225 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 OR10K2Q6IF99 312 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 FDX2Q6P4F2 183 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 TFAP2EQ6VUC0 442 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 NDUFAF7Q7L592 441 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF679Q8IYX0 411 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 GALNT16Q8N428 558 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 METTL21AQ8WXB1 218 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 C12orf57Q99622 126 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 TAS2R4Q9NYW5 299 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 FREM2Q5SZK8 3169 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 C2orf72A6NCS6 295 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 WIPF3A6NGB9 483 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 TSPAN2O60636 221 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 NPIPB7O75200 414 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 IGLV3-19P01714 112 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 LPLP06858 475 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 CXCR1P25024 350 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 S100A11P31949 105 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 RORAP35398 523 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 NR0B2Q15466 257 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 LRFN4Q6PJG9 635 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 TMUB2Q71RG4 321 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 RNF128Q8TEB7 428 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 GPX8Q8TED1 209 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 SLC38A3Q99624 504 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 ABHD6Q9BV23 337 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 LRP12Q9Y561 859 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 SESN1Q9Y6P5 492 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 A0A1W2PPC1 479 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 M0QYG6 137 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF432O94892 652 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 CSF1P09603 554 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 DLX5P56178 289 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 SCAND1P57086 179 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 RPL27P61353 136 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 DEFB133Q30KQ1 61 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 LY6G6FQ5SQ64 297 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 NUP54Q7Z3B4 507 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 COQ8AQ8NI60 647 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 SLC22A8Q8TCC7 542 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 SEH1LQ96EE3 360 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 ARL6Q9H0F7 186 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 LDAHQ9H6V9 325 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 CUTCQ9NTM9 273 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 HPF1Q9NWY4 346 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 KIF25Q9UIL4 384 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 LGALS8O00214 317 aa9.82□□□□□ -0.84
C9orf3-214ENST00000473778 XKRYO14609 159 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms