RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465909.2

SOGA3-201, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 3,756 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-201ENST00000465909 COX5BP10606 129 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 LY6G6FQ5SQ64 297 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 OR4C11Q6IEV9 310 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 APCDD1LQ8NCL9 501 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 TERB2Q8NHR7 220 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 GLYATL1Q969I3 302 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 DHDHQ9UQ10 334 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 DUXAA6NLW8 204 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CLDN4O14493 209 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 POP4O95707 220 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 MBPP02686 304 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ZGLP1P0C6A0 271 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 C5AR1P21730 350 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 PPP2CBP62714 309 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 PPP2CAP67775 309 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 RAB32Q13637 225 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 LYG2Q86SG7 212 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 SOX7Q9BT81 388 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 OR11A1Q9GZK7 315 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 STRCQ7RTU9 1775 aa13.54□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 SEC14L6B5MCN3 397 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 C9JQL5 133 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 BHLHE40O14503 412 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CTAG2O75638 210 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 RPS2P15880 293 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 HRH1P35367 487 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 RBMXP38159 391 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 HTR5AP47898 357 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CCL15Q16663 113 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ASB17Q8WXJ9 295 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 MR1Q95460 341 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 KNTC1P50748 2209 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 SLC5A10A0PJK1 596 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF878C9JN71 531 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 MCIDASD6RGH6 385 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 HNF4GQ14541 408 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 EIPR1Q53HC9 387 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF417Q8TAU3 575 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 TIFAQ96CG3 184 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF840PA6NDX5 716 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 GPANK1O95872 356 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CD160O95971 181 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 GABRA3P34903 492 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 KHDC3LQ587J8 217 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 SLC22A12Q96S37 553 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 DUSP22Q9NRW4 184 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa13.53□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 A6NNC1 897 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 HCKP08631 526 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 CALCBP10092 127 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 TYRP1P17643 537 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 FCGR2CP31995 323 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 NR0B2Q15466 257 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 VWA2Q5GFL6 755 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 COX15Q7KZN9 410 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 RD3Q7Z3Z2 195 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 FAM185AQ8N0U4 392 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 ALG12Q9BV10 488 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 PRSS16Q9NQE7 514 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 OR5AC2Q9NZP5 309 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 LUZP4Q9P127 313 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 SLC22A13Q9Y226 551 aa13.52□□□□□ -0.24
SOGA3-201ENST00000465909 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SOGA3-201ENST00000465909 SLC2A5P22732 501 aa13.52□□□□□ -0.25
SOGA3-201ENST00000465909 GRK6P43250 576 aa13.52□□□□□ -0.25
SOGA3-201ENST00000465909 FAM189A2Q15884 450 aa13.52□□□□□ -0.25
SOGA3-201ENST00000465909 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SOGA3-201ENST00000465909 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SOGA3-201ENST00000465909 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa13.52□□□□□ -0.25
SOGA3-201ENST00000465909 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
SOGA3-201ENST00000465909 OR14J1Q9UGF5 321 aa13.52□□□□□ -0.25
SOGA3-201ENST00000465909 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa13.52□□□□□ -0.25
SOGA3-201ENST00000465909 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa13.52□□□□□ -0.25
SOGA3-201ENST00000465909 C9orf170A2RU37 121 aa13.52□□□□□ -0.25
SOGA3-201ENST00000465909 NPIPB9F8W1W9 429 aa13.52□□□□□ -0.25
SOGA3-201ENST00000465909 NSA2O95478 260 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
SOGA3-201ENST00000465909 CRHP06850 196 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms