RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ADAM8	P78325	824 aa		15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	PSG4	Q00888	419 aa		15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	SHE	Q5VZ18	495 aa		15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR2T33	Q8NG76	320 aa		15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	B9D1	Q9UPM9	204 aa		15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		15.35	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR6C68	A6NDL8	312 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	DCTN6	O00399	190 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	GPANK1	O95872	356 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	HLA-DQA2	P01906	255 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	FAM157B	P0CG42	384 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ANXA8	P13928	327 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CD99	P14209	185 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	FAS	P25445	335 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	STOM	P27105	288 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ADIPOQ	Q15848	244 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	SLC36A3	Q495N2	470 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR6V1	Q8N148	313 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	SNX18	Q96RF0	628 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	CMAHP	Q9Y471	501 aa		15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
USP19-210	ENST00000465902	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	RAB35	Q15286	201 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ATP6AP1	Q15904	470 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ZNF774	Q6NX45	483 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	LNX2	Q8N448	690 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	OTULIN	Q96BN8	352 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	BDH2	Q9BUT1	245 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	NTN4	Q9HB63	628 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ACAN	P16112	2415 aa		15.33	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	VPS13C	Q709C8	3753 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	C5orf49	A4QMS7	147 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902		B9A039	149 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	GPRIN2	O60269	458 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	NDUFS7	O75251	213 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	IFNG	P01579	166 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	LCK	P06239	509 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	FCGR1A	P12314	374 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	PAX1	P15863	534 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	GLO1	Q04760	184 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	MEP1B	Q16820	701 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SYT9	Q86SS6	491 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SVOPL	Q8N434	492 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	NRBF2	Q96F24	287 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	PLK3	Q9H4B4	646 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	FZR1	Q9UM11	496 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	FKBP7	Q9Y680	259 aa		15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902		G3V2T6	193 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	SGCE	O43556	437 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	DOK2	O60496	412 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	OSM	P13725	252 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	ZNF23	P17027	643 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	PYCR1	P32322	319 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	GLRX	P35754	106 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	RAD52	P43351	418 aa		15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
USP19-210	ENST00000465902	AQP6	Q13520	282 aa		15.31	■□□□□ 0.04

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