RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 ITGA2P17301 1181 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 MSR1P21757 451 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 ARHGDIAP52565 204 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 CCL8P80075 99 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 KRT72Q14CN4 511 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 TRIP10Q15642 601 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 CR1LQ2VPA4 569 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 FAM122BQ7Z309 247 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 YIPF5Q969M3 257 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 PYURFQ96I23 114 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 C7orf34Q96L11 122 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 C4orf45Q96LM5 186 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 Q96M85 177 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 SOX7Q9BT81 388 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 WNT5BQ9H1J7 359 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 OR51B6Q9H340 312 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 POLE4Q9NR33 117 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 DECR2Q9NUI1 292 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 AURKCQ9UQB9 309 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRF-210ENST00000463041 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PPL8 197 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 PLSCR5A0PG75 271 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 PRSS37A4D1T9 235 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 IMPA2O14732 288 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 RP2O75695 350 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SCG5P05408 212 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ADH4P08319 380 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 HSD17B1P14061 328 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SDHAP31040 664 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 IL2RGP31785 369 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 WNT5AP41221 380 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 MAGEB1P43366 347 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 GPR4P46093 362 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 OMPP47874 163 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 LIMS1P48059 325 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF81P51508 661 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 MMP15P51511 669 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ERVS71-1P61550 626 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 LMO4P61968 165 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 PPP1CBP62140 327 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SPATS1Q496A3 300 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 LIPNQ5VXI9 398 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF774Q6NX45 483 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 RAB1CQ92928 201 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 COG8Q96MW5 612 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF570Q96NI8 536 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 DIRC2Q96SL1 478 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 CD300AQ9UGN4 299 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 UNC119BA6NIH7 251 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SGCEO43556 437 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 SLC16A7O60669 478 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 CDC14BO60729 498 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRF-210ENST00000463041 NCR1O76036 304 aa6.2□□□□□ -1.42
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