RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 NRIP3Q9NQ35 241 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 ACTR3BQ9P1U1 418 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 GRHPRQ9UBQ7 328 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 SIGLEC7Q9Y286 467 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 LRRC42Q9Y546 428 aa11.33□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 LOC100509620A0A075B734 347 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 ICMTO60725 284 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 LILRA1O75019 489 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 CLPTM1O96005 669 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 STOMP27105 288 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 APEX1P27695 318 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 LAP3P28838 519 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 APLNRP35414 380 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 RPL4P36578 427 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 ALDH3B1P43353 468 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 SELENOVP59797 346 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 ERVK-25P63136 954 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 HSF2Q03933 536 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 CARTPTQ16568 116 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 CHRFAM7AQ494W8 412 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 MTX3Q5HYI7 312 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 LCN8Q6JVE9 175 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 SPATA24Q86W54 205 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 C1orf174Q8IYL3 243 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 SYNPRQ8TBG9 265 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 Q96M85 177 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 TPK1Q9H3S4 243 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 GPR160Q9UJ42 338 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 FZR1Q9UM11 496 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa11.32□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 PRSS37A4D1T9 235 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 LYNX1G3V0Z9 82 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 LMX1BO60663 402 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFB2O95178 105 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV3-13P01766 116 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 HPXP02790 462 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 SCG5P05408 212 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 LCKP06239 509 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 LYNX1P0DP58 116 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 APEHP13798 732 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 ITGA2P17301 1181 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 COL8A2P25067 703 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 FXYD6P3P58550 94 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 PCBD1P61457 104 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 SEC23BQ15437 767 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 MOGQ16653 247 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 MESTQ5EB52 335 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 GPR139Q6DWJ6 353 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 PQLC1Q8N2U9 271 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 AKR7LQ8NHP1 331 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 PYDC1Q8WXC3 89 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 RDH5Q92781 318 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 HPS1Q92902 700 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 C1orf159Q96HA4 380 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 MDFIQ99750 246 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 GPA33Q99795 319 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF416Q9BWM5 594 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 OR2H1Q9GZK4 316 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 WNT5BQ9H1J7 359 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 VCXQ9H320 206 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 POLE4Q9NR33 117 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 TAAR3PQ9P1P4 343 aa11.31□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1W2PPW3 197 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 C12orf71A8MTZ7 269 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 C17orf100A8MU93 164 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 XKRYO14609 159 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 DIRAS1O95057 198 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 TXNDC12O95881 172 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 FAM157CP0CG43 387 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 COX5BP10606 129 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 NAT2P11245 290 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 FCGR1AP12314 374 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 MSR1P21757 451 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 ACHEP22303 614 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 SDHAP31040 664 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 WNT5AP41221 380 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 GDI2P50395 445 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 CHN2P52757 468 aa11.3□□□□□ -0.6
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM33P57088 247 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.2 ms