RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CFAP77Q6ZQR2 320 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LRP11Q86VZ4 500 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LNX2Q8N448 690 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LINC00471Q8N535 108 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR2T33Q8NG76 320 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RBP7Q96R05 134 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CIB1Q99828 191 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RACGAP1Q9H0H5 632 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RNF121Q9H920 327 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SIAEQ9HAT2 523 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ASH2LQ9UBL3 628 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LHFPL6Q9Y693 200 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.13□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ABCA1O95477 2261 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EI24O14681 340 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RER1O15258 196 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DOK2O60496 412 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FARS2O95363 451 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RENP00797 406 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CST2P09228 141 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF35P13682 527 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OSMP13725 252 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPI1P17947 270 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GSTM3P21266 225 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GRK5P34947 590 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ARR3P36575 388 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PTH2RP49190 550 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FABP6P51161 128 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRSS12P56730 875 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HSF2Q03933 536 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GLO1Q04760 184 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ADIPOQQ15848 244 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZSCAN26Q16670 478 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MST1LQ2TV78 715 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC36A2Q495M3 483 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM27BQ5VT28 67 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DTX2Q86UW9 622 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF511Q8NB15 262 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PROKR2Q8NFJ6 384 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NINJ1Q92982 152 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DHRS9Q9BPW9 319 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SYT3Q9BQG1 590 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 YY1AP1Q9H869 796 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 S100A14Q9HCY8 104 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CMC2Q9NRP2 79 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CA10Q9NS85 328 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 POLR1DQ9Y2S0 133 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C5orf63A6NC05 138 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC182A6NF36 153 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SURF4O15260 269 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRKYO43930 277 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMPD2O60906 423 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGHV4-39P01824 125 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CRYAAP02489 173 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SERPINA5P05154 406 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NR2C1P13056 603 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NPR2P20594 1047 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCNOP22674 350 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IGFBP5P24593 272 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TTKP33981 857 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MPV17P39210 176 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 HTR5AP47898 357 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPP2R2BQ00005 443 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CDK5Q00535 292 aa8.11□□□□□ -1.11
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms