RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 BPNT1O95861 308 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ABHD16AO95870 558 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SOD1P00441 154 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 OR51B6Q9H340 312 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 WDR81Q562E7 1941 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SLC2A1P11166 492 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 CAMLGP49069 296 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 RGS19P49795 217 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 GPR85P60893 370 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF585AQ6P3V2 769 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 OR1N1Q8NGS0 311 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ARL11Q969Q4 196 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 PBDC1Q9BVG4 233 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 NUDT9Q9BW91 350 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 IFITM5A6NNB3 132 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ARPC3O15145 178 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SLC34A2O95436 690 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 TPT1P13693 172 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 THEM4Q5T1C6 240 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 CD276Q5ZPR3 534 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ARL5BQ96KC2 179 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 RGCCQ9H4X1 137 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 E9PI62 339 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 HOXB5P09067 269 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 RDH10Q8IZV5 341 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 NELFAQ9H3P2 528 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 A0A1W2PNR3 127 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 MSR1P21757 451 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 WDFY2Q96P53 400 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 MOB1AQ9H8S9 216 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ASH2LQ9UBL3 628 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 V9GYH0 126 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 CACNA1HO95180 2353 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ARID1AO14497 2285 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 IMPA2O14732 288 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 F10P00742 488 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 TBXA2RP21731 343 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 TFF2Q03403 129 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 MZT1Q08AG7 82 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 RHEBQ15382 184 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 DOK3Q7L591 496 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 CARFQ8N187 725 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 PSMF1Q92530 271 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 CALHM2Q9HA72 323 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 EMC7Q9NPA0 242 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 B3GNT2Q9NY97 397 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SLC22A23A1A5C7 686 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF587BE7ETH6 402 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 OR2J2O76002 312 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 QDPRP09417 244 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 RFX2P48378 723 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SORDQ00796 357 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 DOC2BQ14184 412 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SYT9Q86SS6 491 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 OR52I2Q8NH67 350 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 UCN3Q969E3 161 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 RAB9BQ9NP90 201 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 IFNA2P01563 188 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF74Q16587 644 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 RNF128Q8TEB7 428 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 C20orf85Q9H1P6 137 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 SCPEP1Q9HB40 452 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf172-201ENST00000436881 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 164.1 ms