RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARHGAP18Q8N392 663 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MREGQ8N565 214 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR4F15Q8NGB8 312 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR56A4Q8NGH8 313 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR51L1Q8NGJ5 315 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM151AQ8WW52 585 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TOP1MTQ969P6 601 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM131CQ96AQ9 280 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 APH1AQ96BI3 265 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C16orf74Q96GX8 76 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM101Q96IK0 257 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TSSK3Q96PN8 268 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MICU1Q9BPX6 476 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NEUROG2Q9H2A3 272 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LINC00597Q9H2U6 94 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCNJ16Q9NPI9 418 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CHMP5Q9NZZ3 219 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa3.6□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 A0A1W2PQ72 361 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAD51CO43502 376 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KDELR3O43731 214 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DPM1O60762 260 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SRP72O76094 671 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ETHE1O95571 254 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GIPP09681 153 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TDGF1P13385 188 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RAB3BP20337 219 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCNOP22674 350 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GABRR2P28476 465 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TDGF1P3P51864 188 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RPS21P63220 83 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FZD2Q14332 565 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PAGE3Q5JUK9 113 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LCE3AQ5TA76 89 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ADNP2Q6IQ32 1131 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM122BQ7Z309 247 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF547Q8IVP9 402 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD177Q8N6Q3 437 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR6X1Q8NH79 312 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NUBPLQ8TB37 319 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM230Q96A57 120 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ISOC2Q96AB3 205 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SEH1LQ96EE3 360 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RASL11BQ9BPW5 248 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM49BQ9NUQ9 324 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM94Q12767 1356 aa3.59□□□□□ -1.83
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PDS5BQ9NTI5 1447 aa3.59□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PSMB11A5LHX3 300 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 K7ERQ8 282 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZBTB5O15062 677 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SIVA1O15304 175 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SUPT7LO94864 414 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SCELO95171 688 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PAHP00439 452 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HPRT1P00492 218 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRKACBP22694 351 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HTR1EP28566 365 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RFC3P40938 356 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CSKP41240 450 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLDN6P56747 220 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TFDP2Q14188 446 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RPEL1Q2QD12 228 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FRMPD2BQ6IN97 320 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LCN12Q6JVE5 192 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRMT9Q6P2P2 845 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 Q6ZR54 194 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SNX20Q7Z614 316 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.58□□□□□ -1.84
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms