RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423941.5

HDAC6-205, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-205ENST00000423941 SNAP29O95721 258 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 TFP02787 698 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 HMGN1P05114 100 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 SOD3P08294 240 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 PAX1P15863 534 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 DNASE1P24855 282 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 PCBD1P61457 104 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 EFNB1P98172 346 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 GLO1Q04760 184 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 KEAP1Q14145 624 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 TESK1Q15569 626 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 PIGTQ969N2 578 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 FOXN4Q96NZ1 517 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 CXXC4Q9H2H0 198 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 FN3KQ9H479 309 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 EMC7Q9NPA0 242 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa15.97■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 SURF4O15260 269 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 MITFO75030 526 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 GPANK1O95872 356 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 IFNGP01579 166 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 COX5BP10606 129 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 NR4A1P22736 598 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 TTKP33981 857 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 C11orf71Q6IPW1 123 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 OR2T4Q8NH00 348 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 POM121L2Q96KW2 1035 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 FOXC2Q99958 501 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 KCNS3Q9BQ31 491 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 RERGLQ9H628 205 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 ZNF442Q9H7R0 627 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 KRT84Q9NSB2 600 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 KIF17Q9P2E2 1029 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 ATP23Q9Y6H3 246 aa15.96■□□□□ 0.15
HDAC6-205ENST00000423941 LOC100509620A0A075B734 347 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 RIIAD1A6NNX1 92 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 ICMTO60725 284 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 POU1F1P28069 291 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 PCSK6P29122 969 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 EPHA2P29317 976 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 PLP2Q04941 152 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 AQP6Q13520 282 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 PCK2Q16822 640 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 MST1LQ2TV78 715 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 DEFB113Q30KQ7 82 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 LINC01590Q5TEZ4 76 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 TMEM236Q5W0B7 351 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 SLC30A7Q8NEW0 376 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 AKR7LQ8NHP1 331 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 CIB1Q99828 191 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 HCAR1Q9BXC0 346 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 CA10Q9NS85 328 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 USE1Q9NZ43 259 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 POU2F3Q9UKI9 436 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 LHFPL6Q9Y693 200 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 CSMD1Q96PZ7 3565 aa15.95■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 ZAR1LA6NP61 321 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 E9PQ18 207 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 ALPLP05186 524 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 ZNF3P17036 446 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 SPI1P17947 270 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 APEX1P27695 318 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 PYCR1P32322 319 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 GGT2P36268 569 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 TEKQ02763 1124 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 SCRN3Q0VDG4 424 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 MEP1BQ16820 701 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 SWI5Q1ZZU3 235 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 ICA1LQ8NDH6 482 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 OR1J2Q8NGS2 313 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 TMEM171Q8WVE6 324 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 CCL19Q99731 98 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 GABARAPL3Q9BY60 117 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 MARCH7Q9H992 704 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 FAIMQ9NVQ4 179 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 KCNG2Q9UJ96 466 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa15.94■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 SAC3D1A6NKF1 404 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 CLUP10909 449 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 IGFBP5P24593 272 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 STOMP27105 288 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 GLRXP35754 106 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 CENPAP49450 140 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 FABP6P51161 128 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 DAG1Q14118 895 aa15.93■□□□□ 0.14
HDAC6-205ENST00000423941 ADIPOQQ15848 244 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms