RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382740.3

AP002088.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AP002088.1, Length 395 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002088.1-201ENST00000382740 ZNF234Q14588 700 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 KCNAB1Q14722 419 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 RAB11BQ15907 218 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ZNF141Q15928 474 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 KIF26BQ2KJY2 2108 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 C2orf27AQ580R0 203 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 MESTQ5EB52 335 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ALG10BQ5I7T1 473 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 WDR38Q5JTN6 314 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 PHF19Q5T6S3 580 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 FNDC7Q5VTL7 733 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ELP2Q6IA86 826 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 C11orf87Q6NUJ2 197 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 CNKSR3Q6P9H4 555 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 TMEM88Q6PEY1 159 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ENPP7Q6UWV6 458 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 RNF44Q7L0R7 432 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 PRSS41Q7RTY9 318 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 FAM220AQ7Z4H9 259 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 LYG2Q86SG7 212 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 LYPD6Q86Y78 171 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 OR4N5Q8IXE1 308 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 BEST3Q8N1M1 668 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 PRSS35Q8N3Z0 413 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 RAB42Q8N4Z0 105 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 SLC30A7Q8NEW0 376 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 OR1M1Q8NGA1 313 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 OR51A4Q8NGJ6 313 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 OR6K6Q8NGW6 343 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 GPR148Q8TDV2 347 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 SNX33Q8WV41 574 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 LIPHQ8WWY8 451 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 HERVK_113Q902F9 699 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 RSC1A1Q92681 617 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 PMM1Q92871 262 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 RAB7BQ96AH8 199 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 FAM131CQ96AQ9 280 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 TM4SF19Q96DZ7 209 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 VSTM2LQ96N03 204 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 OR2A5Q96R48 311 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 SERINC2Q96SA4 455 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 NMNAT3Q96T66 252 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 AMELYQ99218 206 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 C12orf57Q99622 126 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 NRIP2Q9BQI9 281 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 UQCC2Q9BRT2 126 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ALG12Q9BV10 488 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 PIGMQ9H3S5 423 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 SFXN1Q9H9B4 322 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 TMEM27Q9HBJ8 222 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 FGF22Q9HCT0 170 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 LYRM4Q9HD34 91 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 FANCFQ9NPI8 374 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 CYTL1Q9NRR1 136 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 TMEM100Q9NV29 134 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 TAS2R8Q9NYW2 309 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 PRR13Q9NZ81 148 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 MBD2Q9UBB5 411 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 CTSFQ9UBX1 484 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 SERGEFQ9UGK8 458 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 FBXO4Q9UKT5 387 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ANAPC10Q9UM13 185 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 DAPP1Q9UN19 280 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 VSIG4Q9Y279 399 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 DTX4Q9Y2E6 619 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 SLC22A7Q9Y694 548 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 BRCA2P51587 3418 aa3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 FREM3P0C091 2139 aa3.11□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa3.11□□□□□ -1.91
AP002088.1-201ENST00000382740 ALPK2Q86TB3 2170 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms