RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CA10Q9NS85 328 aa13.34□□□□□ -0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ITPR3Q14573 2671 aa13.31□□□□□ -0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF823P16415 610 aa13.31□□□□□ -0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 C1orf174Q8IYL3 243 aa13.31□□□□□ -0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 AKR7LQ8NHP1 331 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 IGFBPL1Q8WX77 278 aa13.31□□□□□ -0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 GSX2Q9BZM3 304 aa13.31□□□□□ -0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC25A19Q9HC21 320 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 S100A14Q9HCY8 104 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 ASH2LQ9UBL3 628 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 OAZ3Q9UMX2 235 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 CMAHPQ9Y471 501 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 F8P00451 2351 aa13.31□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 C5orf49A4QMS7 147 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM171A2A8MVW0 826 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 B9A039 149 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 H3BNX3 289 aa13.3□□□□□ -0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 OVOL3O00110 214 aa13.3□□□□□ -0.28
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