RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 GFOD1Q9NXC2 390 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 LRP5LA4QPB2 252 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 GPX5O75715 221 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 RUNX2Q13950 521 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa18.5■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SLC2A10O95528 541 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 BHLHE23Q8NDY6 225 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35B4Q969S0 331 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 EDN3P14138 238 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 HNF4GQ14541 408 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 PRSS45Q7RTY3 260 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 OR51S1Q8NGJ8 323 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 C11orf40Q8WZ69 217 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 UHRF2Q96PU4 802 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TJP1Q07157 1748 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 NRAPQ86VF7 1730 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC30A6NM36 301 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 OR5H6Q8NGV6 325 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 C8orf44Q96CB5 159 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 LANCL2Q9NS86 450 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 ICOSLGO75144 302 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 CNR1P21554 472 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 GFERP55789 205 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 B4GALNT1Q00973 533 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 FAHD1Q6P587 224 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM71Q6P5X7 295 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 UBALD2Q8IYN6 164 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 OR1M1Q8NGA1 313 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SLC39A9Q9NUM3 307 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 POMT2Q9UKY4 750 aa18.49■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GTL3 188 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PNR3 127 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD34BA5PLL1 514 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 LMO7DNF2Z398 122 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 OR8B8Q15620 311 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SEC22CQ9BRL7 303 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 HIPK2Q9H2X6 1198 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 BANF2Q9H503 90 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 HSPB2A8KAH6 182 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 GUSBP08236 651 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SERPINF1P36955 418 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 THBS3P49746 956 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 RAB11AP62491 216 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 AKR1C1Q04828 323 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 HSPB2Q16082 182 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 PAQR6Q6TCH4 344 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TAS2R4Q9NYW5 299 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 NKX6-3A6NJ46 265 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 HSBP1L1C9JCN9 74 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TGM6O95932 706 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TRAPPC2P0DI81 140 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TRAPPC2BP0DI82 140 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TBXA2RP21731 343 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SLC7A6Q92536 515 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 DECR2Q9NUI1 292 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 CHST2Q9Y4C5 530 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 LILRA5A6NI73 299 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 DEGS1O15121 323 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2KP61086 200 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 KCNIP4Q6PIL6 250 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SPNS2Q8IVW8 549 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 OR51E1Q8TCB6 317 aa18.48■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SCN9AQ15858 1988 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 ENSAO43768 121 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 SULT1C4O75897 302 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 GRPP07492 148 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM200AQ86VY9 491 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 OPALINQ96PE5 141 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TAF1P21675 1872 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 CTXN2P0C2S0 81 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 LAP3P28838 519 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 CLN3Q13286 438 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 DPPA2Q7Z7J5 298 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF687Q8N1G0 1237 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 MRGPRX4Q96LA9 322 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 KCNJ15Q99712 375 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 RTL8AQ9BWD3 113 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 TXNIPQ9H3M7 391 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 M0R135 149 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 EGR3Q06889 387 aa18.47■□□□□ 0.55
CCSAP-203ENST00000366687 CLINT1Q14677 625 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms