RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 SLC2A5P22732 501 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 TACR3P29371 465 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 MPGP29372 298 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 NBL1P41271 181 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 GXYLT1Q4G148 440 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM205Q6UW68 189 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 PGAP1Q75T13 922 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 PRSS45Q7RTY3 260 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 SYS1Q8N2H4 156 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 LINC00469Q8N7U9 141 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 CYB561A3Q8NBI2 242 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 LGALS14Q8TCE9 139 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 BIN3Q9NQY0 253 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 RXFP3Q9NSD7 469 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 COA4Q9NYJ1 87 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 SPEGQ15772 3267 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 POM121CA8CG34 1229 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 H0YC42 278 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 FCER2P06734 321 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 CCL4P13236 92 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 MGMTP16455 207 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 ITPKBP27987 946 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 GRK6P43250 576 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 EGR4Q05215 589 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF74Q16587 644 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 OR52I2Q8NH67 350 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 NUBPLQ8TB37 319 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 SMIM19Q96E16 107 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 LPAR4Q99677 370 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 OR51V1Q9H2C8 321 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 MLXQ9UH92 298 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 GPR179Q6PRD1 2367 aa16.78■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 ADAM10O14672 748 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 CLUP10909 449 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 AGTR1P30556 359 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 GPR85P60893 370 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 ACTA2P62736 377 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 ACTG2P63267 376 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 MC2RQ01718 297 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF85Q03923 595 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 MICBQ29980 383 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 DNM1P46Q6ZS02 220 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 OR52E2Q8NGJ4 325 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 LIPHQ8WWY8 451 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 C8orf44Q96CB5 159 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 PHYHIPLQ96FC7 376 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 TEAD3Q99594 435 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 RASL12Q9NYN1 266 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 TAS2R10Q9NYW0 307 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 CLEC4AQ9UMR7 237 aa16.77■□□□□ 0.28
SPNS1-204ENST00000352260 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 A0A0D9SG52 128 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 J3QLW9 94 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 IFNA4P05014 189 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF883P0CG24 379 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF19P17023 458 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 PGCP20142 388 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 RPL4P36578 427 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 LINC00303Q3SY05 128 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM255AQ5JRV8 349 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 MOB3CQ70IA8 216 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 C10orf53Q8N6V4 93 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 OR4K13Q8NH42 304 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 ST8SIA2Q92186 375 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 MOGAT1Q96PD6 335 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 FBXL4Q9UKA2 621 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM200CA6NKL6 621 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 FAM74A7A6NL05 159 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 GPRIN2O60269 458 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 KDM4BO94953 1096 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 CALCBP10092 127 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 ACP1P24666 158 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 SLC26A5P58743 744 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 LTBQ06643 244 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 CDK5R1Q15078 307 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 HFEQ30201 348 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 FAM74A3Q4VXF1 159 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 SDR9C7Q8NEX9 313 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 LRFN5Q96NI6 719 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 TBX5Q99593 518 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 PIGMQ9H3S5 423 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRL4Q9HBW9 690 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 MMP25Q9NPA2 562 aa16.76■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 NUDT14O95848 222 aa16.75■□□□□ 0.27
SPNS1-204ENST00000352260 GP1BAP07359 652 aa16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms