RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ASF1BQ9NVP2 202 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 FBXO4Q9UKT5 387 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 B9D1Q9UPM9 204 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 STMND1H3BQB6 276 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ACOT7O00154 380 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 CD3DP04234 171 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 GABRA1P14867 456 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 DPP4P27487 766 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 RAP2BP61225 183 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 COL19A1Q14993 1142 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ACBD4Q8NC06 268 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF426Q9BUY5 554 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 JAM3Q9BX67 310 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 SEC61A2Q9H9S3 476 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 POLE3Q9NRF9 147 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 MMP17Q9ULZ9 603 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 EMC9Q9Y3B6 208 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 PNMTP11086 282 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 GLYATL3Q5SZD4 288 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 CYB5R2Q6BCY4 276 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 CLRN3Q8NCR9 226 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 BPIFCQ8NFQ6 507 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 OR4C16Q8NGL9 310 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 DHDHQ9UQ10 334 aa17.94■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 METTL21EPA6NDL7 271 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 C2CD4DB7Z1M9 353 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 LY86O95711 162 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 CD53P19397 219 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 GMFBP60983 142 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 CARD17Q5XLA6 110 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 TCTN2Q96GX1 697 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 NUDT9Q9BW91 350 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 COPS7AQ9UBW8 275 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 HLA-DOBP13765 273 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 IFNGR1P15260 489 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF28P17035 718 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 MST1P26927 711 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 CASTOR1Q8WTX7 329 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 WBP1Q96G27 269 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD10Q9NXR5 420 aa17.93■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 NSA2O95478 260 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 PPP3CBP16298 524 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 IL11P20809 199 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 MEOX2P50222 304 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 CAPZA1P52907 286 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ELOCQ15369 112 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 FAM69BQ5VUD6 431 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF546Q86UE3 836 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC74AQ96AQ1 378 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 MED29Q9NX70 200 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ARPC3O15145 178 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 POU2F2P09086 479 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 PDSS1Q5T2R2 415 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 TFAP2EQ6VUC0 442 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 S100A6P06703 90 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 SLC2A1P11166 492 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 CAPZBP47756 277 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 KCNJ3P48549 501 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 C2orf76Q3KRA6 126 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 KLHL26Q53HC5 615 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF248Q8NDW4 579 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 PXT1Q8NFP0 134 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 OR51A2Q8NGJ7 313 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF417Q8TAU3 575 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 TAS2R4Q9NYW5 299 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 OPN4Q9UHM6 478 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa17.92■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 AMY2AP04746 511 aa17.91■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF823P16415 610 aa17.91■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 OR7A5Q15622 319 aa17.91■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 PRTGQ2VWP7 1150 aa17.91■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 MANEAQ5SRI9 462 aa17.91■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF615Q8N8J6 731 aa17.91■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 FBRSQ9HAH7 460 aa17.91■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 CKLFQ9UBR5 152 aa17.91■□□□□ 0.46
SPNS2-201ENST00000329078 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms