RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 GPR119Q8TDV5 335 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 RBP7Q96R05 134 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 CA10Q9NS85 328 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ETV7Q9Y603 341 aa14.72□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1W2PQD3 144 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SLC22A23A1A5C7 686 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TO15178 435 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SIGLEC5O15389 551 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 FADS1O60427 444 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 EPHA4P54764 986 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ADAM8P78325 824 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 S100A12P80511 92 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ELFN2Q5R3F8 820 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF227Q86WZ6 799 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 STPG2Q8N412 459 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SLC25A45Q8N413 288 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 D2HGDHQ8N465 521 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GVI7 797 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 TGM6O95932 706 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 PNLIPRP2P54317 469 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 MRI1Q9BV20 369 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SLC39A1Q9NY26 324 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.71□□□□□ -0.05
SHQ1-201ENST00000325599 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ADAM10O14672 748 aa14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 DXOO77932 396 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 BCKDHBP21953 392 aa14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF441Q8N8Z8 693 aa14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 OR52B4Q8NGK2 314 aa14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 MNTQ99583 582 aa14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 GAL3ST1Q99999 423 aa14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 FGF21Q9NSA1 209 aa14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 EMC3Q9P0I2 261 aa14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF69Q9UC07 566 aa14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 A8MVM7 634 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PLPP3O14495 311 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 XRCC3O43542 346 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF432O94892 652 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 MT-ATP6P00846 226 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 POU3F4P49335 361 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 EID2Q8N6I1 236 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 C8orf44Q96CB5 159 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 NPTNQ9Y639 398 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GUH1 482 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GX78 115 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 CTAG2O75638 210 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 METTL11BQ5VVY1 283 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 KRT77Q7Z794 578 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ABHD6Q9BV23 337 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 LDAHQ9H6V9 325 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.7□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 DUX1O43812 170 aa14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 FMODQ06828 376 aa14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SQSTM1Q13501 440 aa14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 RNF128Q8TEB7 428 aa14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 NXPE2Q96DL1 559 aa14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 ARL5BQ96KC2 179 aa14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 GSX2Q9BZM3 304 aa14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.69□□□□□ -0.06
SHQ1-201ENST00000325599 TRAV18A0A075B6X5 111 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms