RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284073.6

MSI2-201, Transcript of musashi RNA binding protein 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI2, Length 6,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI2-201ENST00000284073 MS4A8Q9BY19 250 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 SEC14L6B5MCN3 397 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 EDIL3O43854 480 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 SUOXP51687 545 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 BIDP55957 195 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 AFMIDQ63HM1 303 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 SEH1LQ96EE3 360 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 AQP7O14520 342 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 AQP8O94778 261 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 HRH1P35367 487 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 FAHD1Q6P587 224 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 TSLPQ969D9 159 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 USP3Q9Y6I4 520 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 SOD1P00441 154 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 GUCA2AQ02747 115 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 GPR31O00270 319 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 DVL1O14640 695 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 PTHLHP12272 177 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 CLDN17P56750 224 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 MFAP5Q13361 173 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 OR2W3Q7Z3T1 314 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 GALNT16Q8N428 558 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 CXorf58Q96LI9 332 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 SPACA5Q96QH8 159 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 LYSMD1Q96S90 227 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 VAMP8Q9BV40 100 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 XRCC2O43543 280 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 PRAMEF4O60810 478 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 GABRA2P47869 451 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 KIAA0895LQ68EN5 471 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 TGM5O43548 720 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 ZNF787Q6DD87 383 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 OR2A2Q6IF42 318 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 J3QR89 54 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 CNMDO75829 334 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 LHX4Q969G2 390 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 ASIC5Q9NY37 505 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 RARRES3Q9UL19 164 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 AVPR2P30518 371 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 FOXK1P85037 733 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 OTPQ5XKR4 325 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 SLC24A4Q8NFF2 622 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 MYOTQ9UBF9 498 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 ECI1P42126 302 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 RAB35Q15286 201 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 NKG7Q16617 165 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 UQCC3Q6UW78 93 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 LYG2Q86SG7 212 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 DLL4Q9NR61 685 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 MYADML2A6NDP7 307 aa14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 HMGN4O00479 90 aa14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 CTRB1P17538 263 aa14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 CTRB2Q6GPI1 263 aa14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 GLTPD2A6NH11 291 aa14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 H0YGG7 62 aa14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 CA12O43570 354 aa14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 CHRM2P08172 466 aa14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.48□□□□□ -0.09
MSI2-201ENST00000284073 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms