RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 OR52N1Q8NH53 320 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 IFT27Q9BW83 186 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 LAT2Q9GZY6 243 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 BIN3Q9NQY0 253 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 MED11Q9P086 117 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 GMFGO60234 142 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 SPDEFO95238 335 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 LYPD3O95274 346 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 ACER2Q5QJU3 275 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM156Q8N614 296 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 OR5M9Q8NGP3 310 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 FXYD6Q9H0Q3 95 aa18.26■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 C2orf72A6NCS6 295 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 FAM25EA8MYX2 175 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 PIP5K1CO60331 668 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 ITGA3P26006 1051 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 PTGDSP41222 190 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 HFEQ30201 348 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM255AQ5JRV8 349 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 CDH26Q8IXH8 852 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 NRMQ8IXM6 262 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 CLEC1AQ8NC01 280 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 OR51G2Q8NGK0 314 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 OSTF1Q92882 214 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM27Q9HBJ8 222 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 KLRF1Q9NZS2 232 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 RCE1Q9Y256 329 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0B4J2E0 115 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GWA3 101 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GX12 115 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 PQLC2LA1A4F0 135 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 H0YC42 278 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 IGHA1P01876 353 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 GALP22466 123 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 DYRK1AQ13627 763 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF613Q6PF04 617 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 WDR88Q6ZMY6 472 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 CPOQ8IVL8 374 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 SPICQ8N5J4 248 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 DUSP19Q8WTR2 217 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF524Q96C55 264 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 TBX5Q99593 518 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 PRSS27Q9BQR3 290 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM2Q9C040 744 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD19PQ9H560 264 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 METTL7AQ9H8H3 244 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 BABAM2Q9NXR7 383 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 ICAM5Q9UMF0 924 aa18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GUH1 482 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 PGGHGQ32M88 737 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 ARL9Q6T311 187 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 PXT1Q8NFP0 134 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 BPIFCQ8NFQ6 507 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 MED13Q9UHV7 2174 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0G2JK05 382 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 ARGFXA6NJG6 315 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 IGF2P01344 180 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 HTR1FP30939 366 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 CEACAM19Q7Z692 300 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 MISPQ8IVT2 679 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 BEST3Q8N1M1 668 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 NANPQ8TBE9 248 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM255BQ8WV15 326 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD10Q9NXR5 420 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R3Q9NYW6 316 aa18.24■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 OR2M5A3KFT3 312 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 TP53I11O14683 189 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 ATG12O94817 140 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 HIST1H2ABP04908 130 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 H2AFB1P0C5Y9 115 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 SWI5Q1ZZU3 235 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 HIST1H2ACQ93077 130 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 TEX12Q9BXU0 123 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 FPR3P25089 353 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 MST1P26927 711 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 CCR9P51686 369 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 PRAMEF20Q5VT98 475 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 SAMD8Q96LT4 415 aa18.23■□□□□ 0.51
UBE2B-201ENST00000265339 HRASLSQ9HDD0 168 aa18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms