RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261707.7

SLC6A4-201, Transcript of solute carrier family 6 member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC6A4, Length 6,604 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4-201ENST00000261707 TMEM255BQ8WV15 326 aa9.9□□□□□ -0.82
SLC6A4-201ENST00000261707 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SLC6A4-201ENST00000261707 GABARAPL3Q9BY60 117 aa9.9□□□□□ -0.82
SLC6A4-201ENST00000261707 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SLC6A4-201ENST00000261707 LRRC30A6NM36 301 aa9.9□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 M0QZ24 198 aa9.9□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 CRMP1Q14194 572 aa9.9□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 SYT14P1Q58G82 188 aa9.9□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 C9orf135Q5VTT2 229 aa9.9□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.9□□□□□ -0.83
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SLC6A4-201ENST00000261707 OR6C1Q96RD1 312 aa9.9□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 A4GALTQ9NPC4 353 aa9.9□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 SRPK3Q9UPE1 567 aa9.9□□□□□ -0.83
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SLC6A4-201ENST00000261707 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.89□□□□□ -0.83
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SLC6A4-201ENST00000261707 LYSMD1Q96S90 227 aa9.89□□□□□ -0.83
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SLC6A4-201ENST00000261707 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.89□□□□□ -0.83
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SLC6A4-201ENST00000261707 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.89□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 C17orf105B2RV13 164 aa9.89□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 GPR31O00270 319 aa9.89□□□□□ -0.83
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SLC6A4-201ENST00000261707 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
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SLC6A4-201ENST00000261707 CMTM4Q8IZR5 234 aa9.89□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 SLC43A2Q8N370 569 aa9.89□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa9.89□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 LTB4R2Q9NPC1 389 aa9.89□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 BET1LQ9NYM9 111 aa9.89□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 FITM1A5D6W6 292 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 E5RGE8 158 aa9.88□□□□□ -0.83
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SLC6A4-201ENST00000261707 TACR1P25103 407 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 CLDN10P78369 228 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 DUSP21Q9H596 190 aa9.88□□□□□ -0.83
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SLC6A4-201ENST00000261707 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 ZNF383Q8NA42 475 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 PRR7Q8TB68 274 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 MACROD1Q9BQ69 325 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 CHST8Q9H2A9 424 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 CHST11Q9NPF2 352 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 CBLCQ9ULV8 474 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 SCRG1O75711 98 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 CT45A6P0DMU7 189 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 CT45A5P0DMU8 189 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 CT45A7P0DMV0 189 aa9.88□□□□□ -0.83
SLC6A4-201ENST00000261707 CT45A8P0DMV1 189 aa9.88□□□□□ -0.83
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