RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251722.10

USP40-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene USP40, Length 5,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-201ENST00000251722 ARNTP27540 789 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 MTCP1P56278 107 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 SORDQ00796 357 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 FABP9Q0Z7S8 132 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 DUSP8Q13202 625 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 XKR7Q5GH72 579 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 DOK3Q7L591 496 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 OR51L1Q8NGJ5 315 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 FZD6O60353 706 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 PRPH2P23942 346 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 SIRPAP78324 504 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 HLA-BQ31612 363 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 GDF7Q7Z4P5 450 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 PTP4A1Q93096 173 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 EGLN2Q96KS0 407 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 FAM171A2A8MVW0 826 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 CBX7O95931 251 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 PPIAP62937 165 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 THEM4Q5T1C6 240 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 RFLNAQ6ZTI6 216 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 OR5M8Q8NGP6 311 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 MEGF10Q96KG7 1140 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 NRIP3Q9NQ35 241 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 SEMA4GQ9NTN9 838 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 ABCA3Q99758 1704 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 TSPAN12O95859 305 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 CTXN2P0C2S0 81 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 NAGAP17050 411 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 ACHEP22303 614 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 MPLP40238 635 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 MS4A2Q01362 244 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 ZFP41Q8N8Y5 198 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 ZNF226Q9NYT6 803 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 SLC31A2O15432 143 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 LGI1O95970 557 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 CEACAM5P06731 702 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 GABRG2P18507 467 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 MTNR1BP49286 362 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 MOGAT2Q3SYC2 334 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 SOHLH1Q5JUK2 328 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 C1orf210Q8IVY1 113 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 OR1N1Q8NGS0 311 aa11.69□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 SMIM30A4D0T7 59 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 CBR3O75828 277 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 OR7E24Q6IFN5 339 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 Q6ZSR9 355 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 CLDN22Q8N7P3 220 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 GPBAR1Q8TDU6 330 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 FGF14Q92915 247 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 TMEM59Q9BXS4 323 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 BCL2L10Q9HD36 194 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 PLSCR3Q9NRY6 295 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 A0A1B0GV72 72 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 C7orf72A4D263 438 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 A8MXE2 369 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 PIAS2O75928 621 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 GIPP09681 153 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 GIFP27352 417 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 LTBQ06643 244 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 OR2L13Q8N349 312 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 GGHQ92820 318 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 CRLF2Q9HC73 371 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 GALNT9Q9HCQ5 603 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 CTDSP2O14595 271 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 SSTR4P31391 388 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 FOXK2Q01167 660 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 MARCH3Q86UD3 253 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 GLB1L2Q8IW92 636 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 MITD1Q8WV92 249 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 TOMM40LQ969M1 308 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 SMIM14Q96QK8 99 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 DVL2O14641 736 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 XRCC2O43543 280 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 OR2C1O95371 312 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 MT-CO3P00414 261 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 OR2B8PP59922 312 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 ZNF91Q05481 1191 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 TSSK4Q6SA08 328 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 OXGR1Q96P68 337 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 BARHL1Q9BZE3 327 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 OR51B4Q9Y5P0 310 aa11.68□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 TMEM210A6NLX4 147 aa11.67□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 SEC14L6B5MCN3 397 aa11.67□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 HPGDSO60760 199 aa11.67□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 GAAP10253 952 aa11.67□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 FXYD4P59646 89 aa11.67□□□□□ -0.54
USP40-201ENST00000251722 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms