RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000231526.8

TRAPPC13-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC13, Length 2,715 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13-201ENST00000231526 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 SSR4P51571 173 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 PON3Q15166 354 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 C1orf140Q5VVS0 124 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 DCDC5Q6ZRR9 648 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 USP43Q70EL4 1123 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 KLBQ86Z14 1044 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 CENPSQ8N2Z9 138 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 KDM8Q8N371 416 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 NPEPL1Q8NDH3 523 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 STEAP2Q8NFT2 490 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 KBTBD8Q8NFY9 601 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF596Q8TC21 504 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 M1APQ8TC57 530 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZPLD1Q8TCW7 415 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 ST8SIA1Q92185 356 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 UFD1Q92890 307 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF479Q96JC4 524 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 TSSK2Q96PF2 358 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 ALG8Q9BVK2 526 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 DDA1Q9BW61 102 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 ASPNQ9BXN1 380 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 RACGAP1Q9H0H5 632 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 TMEM185BQ9H7F4 350 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 PTGES2Q9H7Z7 377 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 KLHL21Q9UJP4 597 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF229Q9UJW7 825 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 SSR3Q9UNL2 185 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC13-201ENST00000231526 DCHS1Q96JQ0 3298 aa4.84□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 KMT2EQ8IZD2 1858 aa4.84□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 OR14I1A6ND48 311 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 H7C1C5 153 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 XKRYO14609 159 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ADAM10O14672 748 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ARHGEF9O43307 516 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 GPX5O75715 221 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 TNFSF15O95150 251 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 LALBAP00709 142 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ICAM2P13598 275 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 GRPRP30550 384 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 DLSTP36957 453 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SELENOVP59797 346 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 LCN6P62502 163 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CD300CQ08708 224 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 FOXF1Q12946 379 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 GAMTQ14353 236 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 GPR176Q14439 515 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 FAM122BQ7Z309 247 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 TMEM99Q8N816 258 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 OR4K17Q8NGC6 315 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 OR5J2Q8NH18 312 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ANGPTL6Q8NI99 470 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SMPDL3BQ92485 455 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 BORCS5Q969J3 196 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLAMF9Q96A28 289 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 POTEKPQ9BYX7 375 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ADGRL4Q9HBW9 690 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 PARD6AQ9NPB6 346 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 NDUFB11Q9NX14 153 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 STUB1Q9UNE7 303 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CCDC182A6NF36 153 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 G3V3Y1 287 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 J3QLW9 94 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLC30A4O14863 429 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 NPIPB7O75200 414 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 OR2C1O95371 312 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 BGLAPP02818 100 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 ZNF19P17023 458 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SPI1P17947 270 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 SLC2A5P22732 501 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 F8A1P23610 371 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 CD1BP29016 333 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 UQCRC1P31930 480 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 PTGDSP41222 190 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 HCCSP53701 268 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 MXD1Q05195 221 aa4.83□□□□□ -1.64
TRAPPC13-201ENST00000231526 MADCAM1Q13477 382 aa4.83□□□□□ -1.64
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