RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ZBTB25P24278 435 aa18.51■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 CFPP27918 469 aa18.51■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 PRKXP51817 358 aa18.51■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 PDZK1IP1Q13113 114 aa18.51■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 PLPP4Q5VZY2 271 aa18.51■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 OR10K2Q6IF99 312 aa18.51■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 CORO6Q6QEF8 472 aa18.51■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 PIK3IP1Q96FE7 263 aa18.51■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 FOXN4Q96NZ1 517 aa18.51■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 SELENOIQ9C0D9 397 aa18.51■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 POLE3Q9NRF9 147 aa18.51■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 SLC25A1P53007 311 aa18.5■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 CTXN1P60606 82 aa18.5■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 TBC1D29Q9UFV1 150 aa18.5■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 FANCMQ8IYD8 2048 aa18.5■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 GPR89BP0CG08 455 aa18.5■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 MESTQ5EB52 335 aa18.5■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 SLC41A2Q96JW4 573 aa18.5■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa18.49■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 C10orf53Q8N6V4 93 aa18.49■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa18.49■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 SLC35D2Q76EJ3 337 aa18.49■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 TMEM100Q9NV29 134 aa18.49■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 CASTOR1Q8WTX7 329 aa18.48■□□□□ 0.55
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PMS1-222ENST00000639501 DPP7Q9UHL4 492 aa18.48■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 A0A0B4J2A0 478 aa18.48■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 MYOGP15173 224 aa18.48■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 ABOP16442 354 aa18.48■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 SDHAP31040 664 aa18.48■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 CTNNB1P35222 781 aa18.48■□□□□ 0.55
PMS1-222ENST00000639501 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
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