RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 CDAP32320 146 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC18B1Q6NT16 456 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10H5Q8NGA6 315 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ASB17Q8WXJ9 295 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51E2Q9H255 320 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC61A2Q9H9S3 476 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 PARPBPQ9NWS1 579 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CLCF1Q9UBD9 225 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 GNG8Q9UK08 70 aa22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 AIREO43918 545 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 CELP19835 753 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R43P59537 309 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 AQP6Q13520 282 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR50Q13585 617 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM180AQ6UWF9 173 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 MCEMP1Q8IX19 187 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 GP6Q9HCN6 339 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 POLE4Q9NR33 117 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ACOXLQ9NUZ1 547 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC4AQ9UMR7 237 aa22■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL15A6NJ78 407 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMD9O00233 223 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 SULT1C4O75897 302 aa21.99■■□□□ 1.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 GPR137CQ8N3F9 429 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 TTYH2Q9BSA4 534 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD6Q9BV23 337 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CALHM2Q9HA72 323 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa21.99■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 TMCC2O75069 709 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD16AO95870 558 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 TACSTD2P09758 323 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8G3PP0DMU2 310 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8B4Q96RC9 309 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CDADC1Q9BWV3 514 aa21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00470Q9BZP3 86 aa21.98■■□□□ 1.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa21.98■■□□□ 1.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 KRT8P05787 483 aa21.97■■□□□ 1.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 CRYBB2P43320 205 aa21.97■■□□□ 1.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 RPTNQ6XPR3 784 aa21.97■■□□□ 1.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 LINC00346Q8IVM7 164 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5M9Q8NGP3 310 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52N5Q8NH56 324 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CPT1CQ8TCG5 803 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ST7LQ8TDW4 575 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 NELFAQ9H3P2 528 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 EMC7Q9NPA0 242 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 STUB1Q9UNE7 303 aa21.97■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM8BA6NDV4 472 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 AHRRA9YTQ3 701 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC22A1O15245 554 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 OGG1O15527 345 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRTM2O43300 516 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 GPX5O75715 221 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 EDNRAP25101 427 aa21.96■■□□□ 1.11
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CAPNS1-215ENST00000628018 TSPO2Q5TGU0 170 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 LIPNQ5VXI9 398 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM220AQ7Z4H9 259 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 DCXRQ7Z4W1 244 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF679Q8IYX0 411 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 NABP1Q96AH0 204 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIB1Q96RU8 372 aa21.96■■□□□ 1.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa21.96■■□□□ 1.11
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