RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	NEB	P20929	6669 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SNAP23-223	ENST00000627440	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440		H0YAE9	185 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440		K7EPI3	171 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	LGALS8	O00214	317 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PROSC	O94903	275 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	AKR7A3	O95154	331 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	VAPB	O95292	243 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GZMA	P12544	262 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CDC25B	P30305	580 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	HTR6	P50406	440 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CCNG1	P51959	295 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SESN3	P58005	492 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TAS2R39	P59534	338 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TGFBI	Q15582	683 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OR8B8	Q15620	311 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF583	Q96ND8	569 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	LPA	P08519	4548 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PQ09	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440		G3V2L1	256 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440		M0R3G1	203 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GYPA	P02724	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	APLNR	P35414	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	HNMT	P50135	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SLURP1	P55000	103 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CLDN17	P56750	224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ECH1	Q13011	328 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CHIT1	Q13231	466 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	XKR7	Q5GH72	579 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR151	Q8TDV0	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM114	B3SHH9	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440		M0QZK8	103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A2	O15244	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF208	O43345	1280 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	RGS11	O94810	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	MBD3	O95983	291 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	GHRH	P01286	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	AMBP	P02760	352 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	AMY1A	P04745	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	AMY2A	P04746	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440		P0C879	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CCNA2	P20248	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	COX7A1	P24310	79 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	LCN1	P31025	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	CXCR5	P32302	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SNAP23-223	ENST00000627440	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67

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