RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 UQCRC2P22695 453 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 GDF1P27539 372 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 TRPC1P48995 793 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 GAS1P54826 345 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 NUP107P57740 925 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 RCAN2Q14206 197 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SQLEQ14534 574 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 IQCCQ4KMZ1 466 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 AGKQ53H12 422 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SYT14P1Q58G82 188 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 DCST2Q5T1A1 773 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SAXO2Q658L1 398 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 APOOLQ6UXV4 268 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.71□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 GATSQ8NAP1 163 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 RNF138Q8WVD3 245 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 STACQ99469 402 aa6.71□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 SLC52A3Q9NQ40 469 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 GIN1Q9NXP7 522 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 WIF1Q9Y5W5 379 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.71□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 ZANQ9Y493 2812 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1W2PPW3 197 aa6.7□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 ANP32DO95626 131 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 OR12D1P0DN82 309 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 PTPN6P29350 595 aa6.7□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.7□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 NEURL3Q96EH8 262 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ITCHQ96J02 903 aa6.7□□□□□ -1.34
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ATG4D-210ENST00000588972 FAM107BQ9H098 131 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 UBQLN3Q9H347 655 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 LIME1Q9H400 295 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 RMND5AQ9H871 391 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4D-210ENST00000588972 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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