RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583254.1

CTC1-211, Transcript of CST telomere replication complex component 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTC1, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1-211ENST00000583254 VRK2Q86Y07 508 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 PDZD9Q8IXQ8 264 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 ANKRD42Q8N9B4 389 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 VPS37AQ8NEZ2 397 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 OR2Z1Q8NG97 314 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 OR4K5Q8NGD3 323 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 LHX4Q969G2 390 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 PPP1R36Q96LQ0 422 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 TMEM246Q9BRR3 403 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 SLC19A3Q9BZV2 496 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 PPA2Q9H2U2 334 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 FBLN5Q9UBX5 448 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 CLN8Q9UBY8 286 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 MIOXQ9UGB7 285 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.81□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa5.8□□□□□ -1.48
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CTC1-211ENST00000583254 PHYHO14832 338 aa5.8□□□□□ -1.48
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CTC1-211ENST00000583254 ITM2AO43736 263 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 ENTPD5O75356 428 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 FARS2O95363 451 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
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CTC1-211ENST00000583254 SERPINE1P05121 402 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 CD33P20138 364 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 PRPS1L1P21108 318 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 BGNP21810 368 aa5.8□□□□□ -1.48
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CTC1-211ENST00000583254 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 ETV4P43268 484 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 SLC1A6P48664 564 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 BIDP55957 195 aa5.8□□□□□ -1.48
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CTC1-211ENST00000583254 PPP1CBP62140 327 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 HOXC5Q00444 222 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 HSF2Q03933 536 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 STX3Q13277 289 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 MPP2Q14168 576 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 UGT3A2Q3SY77 523 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 SLC36A2Q495M3 483 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 LIN52Q52LA3 116 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 KLHL22Q53GT1 634 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 RUNDC3AQ59EK9 446 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 FAM201AQ5SY85 155 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
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CTC1-211ENST00000583254 Q6ZR03 302 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 NLRC3Q7RTR2 1065 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 SERPINA11Q86U17 422 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 RIMKLAQ8IXN7 391 aa5.8□□□□□ -1.48
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CTC1-211ENST00000583254 HIPK4Q8NE63 616 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 ABHD4Q8TB40 342 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 SLC38A4Q969I6 547 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 TMEM54Q969K7 222 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 TUBGCP3Q96CW5 907 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 PPP3R2Q96LZ3 170 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 C3orf30Q96M34 536 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 OR2V2Q96R30 315 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 A4GALTQ9NPC4 353 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 ZNRD1Q9P1U0 126 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 KLHL14Q9P2G3 628 aa5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa5.79□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.79□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 LOC100509620A0A075B734 347 aa5.79□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 A0A087WUJ7 227 aa5.79□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 C5orf49A4QMS7 147 aa5.79□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.79□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa5.79□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 OR2T1O43869 369 aa5.79□□□□□ -1.48
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CTC1-211ENST00000583254 OPN1SWP03999 348 aa5.79□□□□□ -1.48
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CTC1-211ENST00000583254 EPHA3P29320 983 aa5.79□□□□□ -1.48
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CTC1-211ENST00000583254 ZNF404Q494X3 552 aa5.79□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa5.79□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 C6orf136Q5SQH8 315 aa5.79□□□□□ -1.48
CTC1-211ENST00000583254 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
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