RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 BIDP55957 195 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 PSG7Q13046 419 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 LIN52Q52LA3 116 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 C5orf46Q6UWT4 87 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 Q6ZR03 302 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 LCA5Q86VQ0 697 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 DTX3Q8N9I9 347 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 Q8NFD4 153 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 NPRL2Q8WTW4 380 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 DPF1Q92782 380 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 ASPNQ9BXN1 380 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.57□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 LRRC30A6NM36 301 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 HMGN4O00479 90 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 PAHP00439 452 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 PF4P02776 101 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 PF4V1P10720 104 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 MYL2P10916 166 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 PRG2P13727 222 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 PAFAH1B1P43034 410 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 ARHGDIAP52565 204 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 ARF6P62330 175 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 PUDPQ08623 228 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 PGS1Q32NB8 556 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 FAM201AQ5SY85 155 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 OR4F3Q6IEY1 312 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 RIMKLAQ8IXN7 391 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 LRRC18Q8N456 261 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 SCAIQ8N9R8 606 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 PPP3R2Q96LZ3 170 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 C1orf50Q9BV19 199 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 ERVK-18Q9QC07 812 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 GIMAP2Q9UG22 337 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.56□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 LOC100509620A0A075B734 347 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 ANGPTL7O43827 346 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 NR2F1P10589 423 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 FAHP16930 419 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 GSTM3P21266 225 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 TAF11Q15544 211 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 ZNF181Q2M3W8 571 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 IL23RQ5VWK5 629 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 PXKQ7Z7A4 578 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 SERPINA11Q86U17 422 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 OR52P1PQ8NH57 321 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 OR6X1Q8NH79 312 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 NSMAFQ92636 917 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 ZNF566Q969W8 418 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 CHID1Q9BWS9 393 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 FUT8Q9BYC5 575 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 RAB18Q9NP72 206 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 A0A1W2PRX2 142 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 C11orf98E9PRG8 122 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 G3V2L1 256 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 H3BUX3 64 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 ICMTO60725 284 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 PEX11AO75192 247 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
GGA3-212ENST00000582376 IFNW1P05000 195 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms