RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 PPP3R1P63098 170 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 SIRPAP78324 504 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TFF2Q03403 129 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TRAF3Q13114 568 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 NFATC2Q13469 925 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 IQGAP2Q13576 1575 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 GK3PQ14409 553 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 NSDHLQ15738 373 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 HSPB2Q16082 182 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CYP1B1Q16678 543 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF181Q2M3W8 571 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 MST1LQ2TV78 715 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CEACAM21Q3KPI0 293 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 FAM153CQ494X1 144 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM196Q5HYL7 178 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 FNBP1LQ5T0N5 605 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 AVPI1Q5T686 147 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 C9orf84Q5VXU9 1444 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 STEAP4Q687X5 459 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 FAM71E1Q6IPT2 247 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TAPT1Q6NXT6 567 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 PNCKQ6P2M8 343 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 DCUN1D2Q6PH85 259 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 NAPRTQ6XQN6 538 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 NRARPQ7Z6K4 114 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 DHDDSQ86SQ9 333 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D26Q86UD7 250 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM139Q8IV31 216 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TCTE3Q8IZS6 198 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 DHRSXQ8N5I4 330 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ACBD7Q8N6N7 88 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC52Q8N7C0 313 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 OR4P4Q8NGL7 312 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 OR6M1Q8NGM8 313 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 OR4A4PQ8NGN8 299 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 OR13C4Q8NGS5 318 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 OR4Q3Q8NH05 313 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 OR5J2Q8NH18 312 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ZFP90Q8TF47 636 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 NPRL2Q8WTW4 380 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ATG4AQ8WYN0 398 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 OVCA2Q8WZ82 227 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 RORBQ92753 470 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 APH1AQ96BI3 265 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TM4SF18Q96CE8 201 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 C10orf35Q96D05 121 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 LGALS12Q96DT0 336 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 MOCOSQ96EN8 888 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF354BQ96LW1 612 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 NODALQ96S42 347 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 RASL10BQ96S79 203 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 SORT1Q99523 831 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 H2AFJQ9BTM1 129 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 NUDT9Q9BW91 350 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 LAT2Q9GZY6 243 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 DCSTAMPQ9H295 470 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ALG9Q9H6U8 611 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 EFCAB1Q9HAE3 211 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 SLC22A11Q9NSA0 550 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 FGF21Q9NSA1 209 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 C14orf105Q9NVL8 296 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CALML5Q9NZT1 146 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 P2RX2Q9UBL9 471 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 SNX12Q9UMY4 172 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 USP22Q9UPT9 525 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 SH2B3Q9UQQ2 575 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 SLC6A5Q9Y345 797 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 WDR45Q9Y484 360 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 MTCH2Q9Y6C9 303 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 MYH10P35580 1976 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CFAP43Q8NDM7 1665 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 DUOX2Q9NRD8 1548 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa2.71□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 ATP7BP35670 1465 aa2.71□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 MBD5Q9P267 1494 aa2.71□□□□□ -1.97
PTPRM-204ENST00000577468 CFAP74Q9C0B2 1584 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 PLCH2O75038 1416 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms