RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576502.5

NDE1-211, Transcript of nudE neurodevelopment protein 1, human

TSL 2

Gene NDE1, Length 1,131 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDE1-211	ENST00000576502	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	ZNF32	P17041	273 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	STOM	P27105	288 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	CDA	P32320	146 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	OMP	P47874	163 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	LIMS1	P48059	325 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	FITM2	Q8N6M3	262 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	FANK1	Q8TC84	345 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	DUSP13	Q9UII6	198 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		11.92	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	PTP4A3	O75365	173 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	DIRAS1	O95057	198 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	SEMG1	P04279	462 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	FAM157B	P0CG42	384 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	DAO	P14920	347 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	CCNO	P22674	350 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	RRM2	P31350	389 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	SLC6A6	P31641	620 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	UCP2	P55851	309 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	FHL1	Q13642	323 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	DHFR2	Q86XF0	187 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	NABP1	Q96AH0	204 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	LRGUK	Q96M69	825 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502		Q96M85	177 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	SYT3	Q9BQG1	590 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	TRIM15	Q9C019	465 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	TMEM129	A0AVI4	362 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	IMPA2	O14732	288 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	FUT4	P22083	530 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	FPR3	P25089	353 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	LAP3	P28838	519 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	CRABP1	P29762	137 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	GCH1	P30793	250 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	NR4A2	P43354	598 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	GZMK	P49863	264 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	ARHGDIA	P52565	204 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	GGTLC2	Q14390	218 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	SEC23B	Q15437	767 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	MEST	Q5EB52	335 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	FAM122B	Q7Z309	247 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	POLE4	Q9NR33	117 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NDE1-211	ENST00000576502	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NDE1-211	ENST00000576502	C5orf49	A4QMS7	147 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NDE1-211	ENST00000576502		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NDE1-211	ENST00000576502	INAFM1	C9JVW0	142 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NDE1-211	ENST00000576502		H3BSA7	217 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NDE1-211	ENST00000576502		H7C1C5	153 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NDE1-211	ENST00000576502	SOCS2	O14508	198 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NDE1-211	ENST00000576502	IDH3B	O43837	385 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NDE1-211	ENST00000576502	LY6H	O94772	140 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NDE1-211	ENST00000576502	REN	P00797	406 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NDE1-211	ENST00000576502	COX5B	P10606	129 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NDE1-211	ENST00000576502	CCL2	P13500	99 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NDE1-211	ENST00000576502	ZNF250	P15622	560 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NDE1-211	ENST00000576502	NOS3	P29474	1203 aa		11.89	□□□□□ -0.51

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